ХАРАКТЕРИСТИКА МИКРОБИОМА ПРИ ВОСПАЛИТЕЛЬНЫХ ЗАБОЛЕВАНИЯХ КИШЕЧНИКА
Аннотация
В обзоре рассмотрены современные представления о состоянии микробиома у здоровых людей и его изменение при воспалительных заболеваниях кишечника.
Об авторах
И. Д. Лоранская
ФГБОУ ДПО Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования Минздрава России
Россия
Россия
И. Л. Халиф
ФГБОУ ДПО Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования Минздрава России; ФГБУ «Государственный научный центр колопроктологии им. А. Н. Рыжих» Минздрава России
Россия
Россия
М. Н. Болдырева
ФГБУ «ГНЦ Институт иммунологии» ФМБА России
Россия
Россия
В. А. Купаева
ФГБОУ ДПО Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования Минздрава России
Россия
Россия
Список литературы
1. Atlas. Vospalitel’nye zabolevaniya kishechnika: diagnostika i lechenie / pod red. prof. Halifa I. L., chlen-korr. RAN Shelygina YU.A. SPb: Gippokrat. - 2017. - 116 S.
2. Loranskaya I.D., Boldyreva M. N., Lavrent’eva O. A. Sostav mukoznoj mikroflory zheludochno-kishechnogo trakta pri sindrome razdrazhennogo kishechnika. Eksperimental’naya i klinicheskaya gastroehnterologiya. - 2013. - № 3. - S. 15-22.
3. Pristenochnaya mikroflora kishechnika // I. D. Loranskaya i dr. - M.: Prima Print, 2015. - 100 S.
4. Chaplin A.V., Rebrikov D. V., Boldyreva M. N. Mikrobiom cheloveka // VESTNIK RGMU. - 2017. - № 2. - S. 5-13.
5. Al-Mofarreh M.A., Al-Mofleh I. A. Emerging inflammatory bowel disease in Saudi outpatients: a report of 693 cases // Saudi J Gastroenterol. - 2013. - № 19. - Р.16-22.
6. Ananthakrishnan A. N. Epidemiology and risk factors for IBD // Nat Rev Gastroenterol Hepatol. - 2015. - № 12. - Р. 205-17.
7. Biasco G., Zannoni U., Paganelli G. M. et al. Folic acid supplementation and cell kinetics of rectal mucosa in patients with ulcerative colitis // Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev. - 1997. - № 6. - Р.469-471.
8. Cho J.H., Brant S. R. Recent insights into the genetics of inflammatory bowel disease // Gastroenterology. - 2011. - № 140. - Р.1704-12.
9. Clemente J.C., Ursell L. K., Parfrey L. W. et al. The impact of the gut microbiota on human health: an integrative view // Cell. - 2012. - № 148. - Р. 1258-70.
10. Darfeuille-Michaud A., Boudeau J., Bulois P. et al. High prevalence of adherent-invasive Escherichia coli associated with ileal mucosa in Crohn’s disease // Gastroenterology. - 2004. - № 127. - Р.412-421.
11. Devkota S., Wang Y., Musch M. W. et al. Dietary-fat-induced taurocholic acid promotes pathobiont expansion and colitis in Il10-/- mice // Nature. - 2012. - № 487(7405). - Р.104-8.
12. Fanaro S., Chierici R., Guerrini P. et al. Intestinal microflora in early infancy: composition and development // Acta pediat. - 2003. - V. 91(441). - P. 48-55.
13. Flint H.J., Bayer E. A., Rincon M. T. et al. Polysaccharide utilization by gut bacteria: potential for new insights from genomic analysis // Nat. Rev. Microbiol. - 2008. - № 6. - Р.121-131.
14. Floch M. H. Intestinal microecology in health and wellness // J Clin Gastroenterol. - 2011. - № 45. - Р.108-10.
15. Frank D.N., Amand A. L. St, Feldman R. A. et al. Molecular-phylogenetic characterization of microbial community imbalances in human inflammatory bowel diseases // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. - 2007. - № 104. - P. 13780-13785.
16. Frick J.S., Autenrieth I. B. The gut microflora and its variety of roles in health and disease // Curr Top Microbiol Immunol. - 2013. - № 358. - Р.273-89.
17. Garrett W.S., Gallini C. A., Yatsunenko T. et al. Enterobacteriaceae act in concert with the gut microbiota to induce spontaneous and maternally transmitted colitis // Cell Host Microbe. - 2010. - № 8. - Р.292-300.
18. Geddes K., Rubino S., Streutker C., et al. Nod1 and Nod2 regulation of inflammation in the Salmonella colitis model // Infect. Immun. - 2010. - № 78. - Р.5107-5115.
19. Hugot J.P., Chamaillard M., Zouali H. et al. Association of NOD2 leucine-rich repeat variants with susceptibility to Crohn’s disease // Nature. - 2001. - № 411. - Р.599-603.
20. Kang S., Denman S. E., Morrison M. et al. Dysbiosis of fecal microbiota in Crohn’s disease patients as revealed by a custom phylogenetic microarray // Inflamm. Bowel Dis. - 2010. - № 16. - P. 2034-2042.
21. Khor B., Gardet A., Xavier R. J. Genetics and pathogenesis of inflammatory bowel disease // Nature. - 2011. - № 474. - Р. 307-17.
22. Lopez-Siles M., Khan T. M., Duncan S. H. et al. Cultured representatives of two major phylogroups of human colonic Faecalibacterium prausnitzii can utilize pectin, uronic acids, and host-derived substrates for growth // Appl. Environ. Microbiol. - 2012. - № 78. - Р.420-428.
23. Machiels K., Joossens M., Sabino J. et al. A decrease of the butyrate-producing species Roseburia hominis and Faecalibacterium prausnitzii defines dysbiosis in patients with ulcerative colitis // Gut. - 2014. - № 63. - Р.1275-1283.
24. Man S.M., Kaakoush N. O., Leach S. T. et al. Host attachment, invasion, and stimulation of proinflammatory cytokines by Campylobacter concisus and other non-Campylobacter jejuni Campylobacter species // J. Infect. Dis. - 2010. - № 202. - Р.1855-1865.
25. Martinez-Medina M., Garcia-Gil L. J. Escherichia coli in chronic inflammatory bowel diseases: An update on adherent invasive Escherichia coli pathogenicity // World J Gastrointest Pathophysiol. - 2014. - № 5(3). - Р.213-27.
26. Mazmanian S. K., Round J. L., Kasper D. L. A microbial symbiosis factor prevents intestinal inflammatory disease // Nature. - 2008. - № 453. - Р.620-625.
27. Morgan X.C., Tickle T. L., Sokol H. et al. Dysfunction of the intestinal microbiome in inflammatory bowel disease and treatment // Genome Biol. - 2012. - № 13. - R79.
28. Mukhopadhya I., Hansen R., El-Omar E.M. et al. IBD-what role do Proteobacteria play? // Nat. Rev. Gastroenterol. Hepatol. - 2012. - № 9. - Р.219-230.
29. Muyzer G., Stams A. J. The ecology and biotechnology of sulphate-reducing bacteria // Nat. Rev. Microbiol. - 2008. - № 6. - Р.441-454.
30. Nagao-Kitamoto H., Kamada N. Host-microbial Cross-talk in Inflammatory Bowel Disease // Immune Netw. - 2017. - № 17(1). - Р.1-12.
31. Ogura Y., Bonen D. K., Inohara N. et al. A frameshift mutation in NOD2 associated with susceptibility to Crohn’s disease // Nature. - 2001. - № 411. - Р. 603-6.
32. Qin J.J., Li R. Q., Raes J. et al. A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing // Nature. - 2010. - № 464. - Р.59-65.
33. Rehman A., Lepage P., Nolte A. et al. Transcriptional activity of the dominant gut mucosal microbiota in chronic inflammatory bowel disease patients // J. Med. Microbiol. - 2010. - № 59. - Р.1114-1122.
34. Rowan F., Docherty N. G., Murphy M. et al. Desulfovibrio bacterial species are increased in ulcerative colitis // Dis. Colon Rectum. - 2010. - № 53. - Р.1530-1536.
35. Ruby T., McLaughlin L., Gopinath S. et al. Salmonella’s long-term relationship with its host // FEMS Microbiol. Rev. - 2012. - № 36. - Р.600-615.
36. Sender R., Fuchs S., Milo R. Revised estimates for the number of human and bacteria cells in the body // PLoS Biol. - 2016. - 14: e1002533.
37. Sokol H., Pigneur B., Watterlot L. et al. O. Faecalibacterium prausnitzii is an anti-inflammatory commensal bacterium identified by gut microbiota analysis of Crohn disease patients // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. - 2008. - № 105. - Р.16731-16736.
38. Sokol H., Seksik P., Rigottier-Gois L. et al. Specificities of the fecal microbiota in inflammatory bowel disease // Inflamm. Bowel Dis. - 2006. - № 12. - Р.106-111.
39. Sonnenburg J.L., Backhed F. Diet-microbiota interactions as moderators of human metabolism // Nature. - 2016. - № 535. - Р.56-64.
40. Theriot C.M., Koenigsknecht M. J., Carlson P. E. et al. Antibiotic-induced shifts in the mouse gut microbiome and metabolome increase susceptibility to Clostridium difficile infection // Nat. Commun. - 2014. - № 5. - Р.3114.
41. Wagner J., Short K., Catto-Smith A.G. et al. Identification and characterisation of Pseudomonas 16S ribosomal DNA from ileal biopsies of children with Crohn’s disease // PLoS One. - 2008. - 3: e3578.
42. Waidmann M., Bechtold O., Frick J. S. et al. Bacteroides vulgatus protects against Escherichia coliinduced colitis in gnotobiotic interleukin-2-deficient mice // Gastroenterology. - 2003. - № 125. - Р.162-177.
43. Wexler H. M. Bacteroides: the good, the bad, and the nitty-gritty // Clin. Microbiol. Rev. - 2007. - № 20. - Р.593-621.
44. Wilson J.C., Furlano R. I., Jick S. S. et al. Inflammatory bowel disease and the risk of autoimmune diseases // J Crohns Colitis. - 2016. - № 10. - Р.186-93.
45. Wong S.H., Ng S. C. What can we learn from inflammatory bowel disease in developing countries? // Curr Gastroenterol Rep. - 2013. - № 15. - Р.313.
46. Yatsunenko T., Rey F. E., Manary M. J. et al. Human gut microbiome viewed across age and geography // Nature. - 2012. - № 486. - Р.222-7.
Рецензия
Для цитирования:
Лоранская И.Д., Халиф И.Л., Болдырева М.Н., Купаева В.А. ХАРАКТЕРИСТИКА МИКРОБИОМА ПРИ ВОСПАЛИТЕЛЬНЫХ ЗАБОЛЕВАНИЯХ КИШЕЧНИКА. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2018;(5):104-111.
For citation:
Loranskaya I.D., Khalif I.L., Boldyreva M.N., Kupaeva V.A. CHARACTERISTIC OF MICROBIOME IN INFLAMMATORY BOWEL DISEASE (REVIEW). Experimental and Clinical Gastroenterology. 2018;(5):104-111. (In Russ.)
Просмотров: 206
Послать статью по эл. почте 