Preview

Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология

Расширенный поиск

ИЗМЕНЕНИЯ СОСТАВА МИКРОБИОТЫ КИШЕЧНИКА У ПАЦИЕНТОВ С ЯЗВЕННЫМ КОЛИТОМ

Аннотация

Цель исследования: изучить особенности кишечной микробиоты у пациентов с язвенным колитом. Материалы и методы исследования: в исследование были включены 46 пациентов с язвенным колитом (25 мужчин и 21 женщина, средний возраст пациентов - 42,4±13,8 лет, длительность заболевания: 5,4 ± 8,2 лет). Для анализа были использованы результаты секвенирования образцов кала пациентов с язвенным колитом и 96 здоровых добровольцев. Полногеномное секвенирование осуществлялось на платформе SOLiD 5500 W (Life Technologies, Foster City, CA, USA). Результаты: метагеномный анализ позволил детектировать в составе микробиоты кишечника у пациентов с язвенным колитом 29 классов бактерий, в том числе: 73 семейства, 154 рода, 437 вида микроорганизмов. На прокариотическую часть микробиоты приходится 99,5 % (из них 98,2 % - Bacteria, 1,8 % - Archaea), на вирусы - 0,5 %, эукариоты - 0,004 %. Таксономический анализ выявил изменения у пациентов с язвенным колитом по сравнению с группой контроля в относительной представленности бактериальных семейств: наблюдалось снижение Lachnospiraceae, Rikenellaceae, Acidaminococcaceae, Enterococcaceae, Desulfovibrionaceae, Verrucomicrobiaceae, Clostridiaceae и увеличение Enterobacteriaceae. Cреди представителей семейства Enterobacteriaceae значимо отличался только род Escherichia, вид Escherichia coli. У пациентов с язвенным колитом представленность Escherichia составила (3,74±8,01)% и была больше, чем в группе контроля - (1,49±5,23)%, тогда как содержание Clostridium - (1,15±3,35)% - было значительно меньше у пациентов с язвенным колитом, чем в группе контроля - (2,33±4,26)%. При анализе биообразцов пациентов с язвенным колитом обнаружено снижение по сравнению с группой контроля индекса альфа-разнообразия, который характеризует богатство микробного сообщества. Выводы: у пациентов с язвенным колитом выявлены значительные изменения таксономического состава микробиоты по сравнению с образцами контрольной группы.

Для цитирования:


Данилова Н.А., Абдулхаков С.Р., Григорьева Т.В., Маркелова М.И., Павленко А.В., Тяхт А.В., Дубинкина В.Б., Кострюкова Е.С., Ларин А.К., Скородумова Л.О., Манолов А.И., Одинцова А.Х., Абдулхаков Р.А. ИЗМЕНЕНИЯ СОСТАВА МИКРОБИОТЫ КИШЕЧНИКА У ПАЦИЕНТОВ С ЯЗВЕННЫМ КОЛИТОМ. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2017;(6):54-60.

For citation:


Danilova N.A., Abdulkhakov S.R., Grigoryeva T.V., Markelova M.I., Pavlenko A.V., Tyakht A.V., Dubinkina V.B., Kostryukova E.S., Larin A.K., Skorodumova L.O., Manolov A.I., Odintsova A.K., Abdulkhakov R.A. CHANGES OF INTESTINAL MICROBIOTA IN PATIENTS WITH ULCERATIVE COLITIS. Experimental and Clinical Gastroenterology. 2017;(6):54-60. (In Russ.)

Просмотров: 322


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 1682-8658 (Print)