INTESTINAL MICROBIOTA IN CROHN’S DISEASE: THE COMPOSITION AND CONNECTION WITH THE CLINICAL COURSE OF THE DISEASE
Abstract
About the Authors
A. A. ShipovskayaRussian Federation
O. P. Dudanova
Russian Federation
References
1. Парфенов А. И. Болезнь Крона // Парфенов А. И. Энтерология. - Москва: Триада-Х, 2002. - 744 с.
2. Fiocchi C. Inflammatory bowel diseases pathogenesis: where are we? // J. Gastroenterol. and Hepatol. - 2015. - Vol. 30 (№ 1). - P. 12-18.
3. Маев И. В., Андреев Д. Н, Ракитина Д. В., Байкова Ю. П. Роль дефектов аутофагии и значение адгезивно-инвазивных Escherichia coli в генезе болезни Крона // РЖГГК. - 2015. - № 3. - С. 61-69.
4. Осипов Г. А., Парфенов А. И., Верховцева Н. В. Клиническое значение исследования микроорганизмов слизистой оболочки кишечника культурально-биохимическим и хромато-масс-спектрометрическим методами // Эксп. и Клин. Гастроэнтерология. - 2003. - Т. 4. - С. 59-67.
5. Jostins L., Ripke S., Weersma R. K. et al. Host-microbe interactions have shaped the genetic architecture of inflammatory bowel disease // Nature. - 2012. - Vol. 491. - P. 119-124.
6. Qin J., Li R., Raes J. et al. A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing // Nature. - 2010. - Vol. 464. - P. 59-65.
7. Kang S., Denman S. E., Morrison M. et al. Dysbiosis of fecal microbiota in Crohn’s disease patients as revealed by a custom phylogenetic microarray // Inflamm. Bowel Dis. - 2010. - Vol. 16. - P. 2034-2042.
8. Andoh A., Imaeda H., Aomatsu T. et al. Comparison of the fecal microbiota profiles between ulcerative colitis and Crohn’s disease using terminal restriction fragment length polymorphism analysis // J. Gastroenterol. - 2011. - Vol. 46. - P. 479-486.
9. Morgan X. C., Tickle T. L., Sokol H. et al. Dysfunction of the intestinal microbiome in inflammatory bowel disease and treatment // Genome Biol. -2012. - Vol. 13. - P. R79.
10. Gevers D., Kugathasan S., Denson L. A. et al. The treatment-naive microbiome in new-onset Crohn’s disease // Cell Host Microbe. - 2014. - Vol. 15. - P. 382-392.
11. Маев И. В., Андреев Д. Н., Ракитина Д. В. и др. Болезнь Крона и адгезивно-инвазивные Escherichia coli: патогенетические параллели // Consilium medicum. - 2015. - Т. 17 (12). - С. 40-43.
12. Hansen R., Russell R. K., Reiff C. et al. Microbiota of de-novo pediatric IBD: increased Faecalibacterium prausnitzii and reduced bacterial diversity in Crohn’s but not in ulcerative colitis // Am. J. Gastroenterol. - 2012. - Vol. 107. - P. 1913-1922.
13. Fujimoto T., Imaeda H., Takahashi K. et al. Decreased abundance of Faecalibacterium prausnitzii in the gut microbiota of Crohn’s disease // J. Gastroenterol. Hepatol. - 2012. - Vol. 28. - P. 613-619.
14. Manichanh C., Borruel N., Casellas F. et al. The gut microbiota in IBD // Nat. Rev. Gastroenterol. Hepatol. - 2012. - Vol. 9. - P. 599-608.
15. Manichanh C., Rigottier-Gois L., Bonnaud E. et al. Reduced diversity of faecal microbiota in Crohn’s disease revealed by a metagenomics approach // Gut. - 2006. - Vol. 55. - P. 205-211.
16. Haberman Y., Tickle T. L., Dexheimer P. J. et al. Pediatric Crohn disease patients exhibit specific ileal transcriptome and microbiome signature // J. Clin. Invest. - 2014. - Vol. 124. - P. 3617-3633.
17. Белоусова Е. А. Рекомендации по диагностике и лечению болезни Крона // Фарматека. - 2009. - № 13. - С. 38-44.
18. Осипов Г. А., Родионов Г. Г. Применение метода масс-спектрометрии микробных маркеров в клинической практике // Лабораторная диагностика. - 2013. - № 2. - С. 68-73.
19. Plé C., Richoux R., Jardin J., Nurdin M. et al. Single-strain starter experimental cheese reveals anti-inflammatory effect of Propionibacterium freudenreichii CIRM BIA 129 in TNBS-colitis model // Journal of Functional Foods. - 2015. - Vol. 18 (A). - P. 575-585.
20. Gophna U., Sommerfeld K., Gophna S. et al. Differences between tissue-associated intestinal microfloras of patients with Crohn’s disease and ulcerative colitis // Journal of Clinical Microbiology. - 2006. - Vol. 44 (11). - P. 4136-4141.
21. Yu Q., Zhang S., Li L. et al. Enterohepatic Helicobacter Species as a Potential Causative Factor in Inflammatory Bowel Disease: A Meta-Analysis. // Medicine (Baltimore). 2015. - 94 (45): e1773.
22. Papamichael K., Konstantopoulos P., Mantzaris G. J. Helicobacter pylori infection and inflammatory bowel disease: is there a link? // World J Gastroenterol. 2014. - 20, № 21. - Р. 6374-85.
Review
For citations:
Shipovskaya A.A., Dudanova O.P. INTESTINAL MICROBIOTA IN CROHN’S DISEASE: THE COMPOSITION AND CONNECTION WITH THE CLINICAL COURSE OF THE DISEASE. Experimental and Clinical Gastroenterology. 2016;(12):49-54. (In Russ.)