Анализ состояния кишечной микробиоты методом ПЦР при воспалительных заболеваниях кишечника у детей

Цель - оптимизация лечения пациентов с язвенным колитом (ЯК) и болезнью Крона (БК) с учетом бактериального разнообразия микробной флоры кишечника при воспалительных заболеваниях кишечника. Материалы и методы. В ходе исследования были проанализированы результаты микробиоты 243 пациентов, госпитализированных в 2021-2023 гг. в 1 педиатрическое отделение Университетской клиники ФГБОУ ВО «ПИМУ» Минздрава России с подтвержденным язвенным колитом (61,7%, n=150/243) и болезнью Крона (38,3%, n=93/243). Диагноз устанавливался на основании общепринятых критериев в соответствии с рекомендациями ECCO. Из них 134 мальчиков (55,1%) и 109 девочек (44,9%). Все дети были разделены на следующие возрастные группы, согласно классификации ВОЗ: 1-3 лет 6 пациентов (2,5%), 3-7 лет - 25 пациентов (10,3%), мальчики 7-12 лет - 44 пациента (18,1%), девочки 7-11 лет- 25 пациентов (10,3%), мальчики 12-16 лет - 53 пациент (21,8%), девочки 11-15 лет - 40 (16,5%), мальчики 16-21 год - 20 (8,2%), девочки 15-20 лет - 30 (12,3%). В работе был использован метод ПЦР, позволяющий с помощью тест- системы «Колонофлор-16» (производитель компания Альфалаб (Санкт-Петербург)) производить количественную оценку состояния микробиоценоза толстой кишки у детей и взрослых в режиме реального времени. Результаты. В ходе работы доказали, что воспалительные заболевания кишечника напрямую связаны с изменением состава микробиоты, так как при язвенном колите и болезни Крона в 99% случаев наблюдались изменения отличные от нормобиоты толстой кишки. При разных вариантах течения имели место достоверные отличия микробного пейзажа. Кроме этого, болезнь Крона и язвенный колит имеют ряд различий между представителями микробиоты толстой кишки. При язвенном колите чаще наблюдается снижение лактобацилл, р=0,033. При болезни Крона чаще выявлялось повышение бактерий Staphylococcus aureus (р=0,001) и повышение Clostridium perfringens (р=0,026). Заключение. Таким образом, при постановке диагноза язвенный колит и болезнь Крона необходимо обследование микробиоты и дотация дифференцированных пробиотических групп бактерий в период долечивания, так как в 58%-70% случаев наблюдалось снижение лактобацилл. p=0,033.

1. Chen J., Siliceo S.L., Ni Y., Nielsen H.B., Xu A., Panagiotou G. Identification of robust and generalizable biomarkers for microbiome-based stratification in lifestyle interventions. Microbiome. 2023 Aug 8;11(1):178. doi: 10.1186/s40168-023-01604-z.

2. Voroshilina E.S., Moskvina M.V., Kirillov M. Yu., Ogneva L.V., Donnikov A.E., Itani T.M., Amineva P.G., Zornikov D.L. Fundamental principles of modern approaches to the assessment of the intestinal microbiota of children. Neonatology: news, opinions, training. 2023; 11 (3): 47-59. doi: 10.33029/2308-2402-2023-11-3-47-59.@@ Ворошилина Е.С., Москвина М.В., Кириллов М.Ю., Огнева Л.В., Донников А.Е., Итани Т.М., Аминева П.Г., Зорников Д.Л. Фундаментальные основы современных подходов к оценке микробиоты кишечника детей. Неонатология: новости, мнения, обучение. 2023; 11 (3): 47-59. doi: 10.33029/2308-2402-2023-11-3-47-59.

3. Kornienko E.A., Khavkin A.I., Fedulova E.N. et al. Draft recommendations of the Russian Society of pediatric gastroenterologists, hepatologists and nutritionists on the diagnosis and treatment of Crohn’s disease in children. Experimental and clinical gastroenterology. 2019;171(11): 100-134. doi: 10.31146/1682-8658-ecg-171-11-100-134.@@ Корниенко Е.А., Хавкин А.И., Федулова Э.Н. и др. Проект рекомендаций российского общества детских гастроэнтерологов, гепатологов и нутрициологов по диагностике и лечению болезни Крона у детей. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2019;171(11): 100-134. doi: 10.31146/1682-8658-ecg-171-11-100-134.

4. Golovenko O.V., Khomeriki S.G., Ivanova E.V. et al. “Inflammatory bowel diseases” second edition, Prima Print, Moscow; 2022. (in Russ.)@@ Головенко О.В., Хомерики С.Г., Иванова Е.В. и др. «Воспалительные заболевания кишечника» второе издание, Прима Принт, Москва; 2022 г.

5. Belousova E.A., Shelygina Yu.A. “Ulcerative colitis clinical recommendations for diagnosis and conservative treatment edited by E.A. Belousova, Yu.A. Shelygin”. Moscow: Pi Kvadrat; 2021. (in Russ.)@@ Белоусова Е.А., Шелыгина Ю.А. «Язвенный колит клинические рекомендации по диагностике и консервативному лечению под редакцией Е.А. Белоусовой, Ю.А. Шелыгина». Москва: Пи Квадрат; 2021.

6. Sitkin S.I., Vakhitov CH.A., Demyanova E.V. Microbiome, colon dysbiosis and inflammatory bowel diseases: when function is more important than taxonomy. The Almanac of Clinical Medicine. 2018;46(5):396-425. (in Russ.) doi: 10.18786/2072-0505-2018-46-5-396-425.@@ Ситкин С.И., Вахитов Т.Я., Демьянова Е.В. Микробиом, дисбиоз толстой кишки и воспалительные заболевания кишечника: когда функция важнее таксономии. Альманах клинической медицины. 2018;46(5):396-425. doi: 10.18786/2072-0505-2018-46-5-396-425.

7. Zhang A., Wang F., Li D., Wang C.Z., Yao H., Wan J.Y., Yuan C.S. Emerging insights into inflammatory bowel disease from the intestinal microbiota perspective: a bibliometric analysis. Front Immunol. 2023 Oct 26;14:1264705. doi: 10.3389/fimmu.2023.1264705.

8. Gauss O.V., Akhmedov V.A. The effect of changes in the intestinal microbiota on the course of inflammatory bowel diseases. Attending physician. 2018;(8): 24-28. (in Russ.)@@ Гаус О.В., Ахмедов В.А. Влияние изменений кишечной микробиоты на течение воспалительных заболеваний кишечника. Лечащий врач. 2018; 8: 24-28.

9. Halaweish H.F., Boatman S., Staley C. Encapsulated Fecal Microbiota Transplantation: Development, Efficacy, and Clinical Application. Front Cell Infect Microbiol. 2022 Mar 17;12:826114. doi: 10.3389/fcimb.2022.826114.

10. Vlasov V.V., Morozov V.V.Russian experience of fecal microbiota transplantation. Experimental and clinical gastroenterology. 2023;212(4): 113-120. (in Russ.) doi: 10.31146/1682-8658-ecg-212-4-113-120.@@ Власов В.В., Морозов В.В. Российский опыт трансплантации фекальной микробиоты. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2023;212(4): 113-120. doi: 10.31146/1682-8658-ecg-212-4-113-120.

11. Shrayner E.V., Khavkin A.I., Novikova M.S., Tikunov A. Yu., Chechushkov A.V., Kharakhorin R.A., Tikunova N.V. Modern strategies and prospects for the treatment of ulcerative colitis. Experimental and Clinical Gastroenterology. 2023;209(1): 149-157. (In Russ.) doi: 10.31146/1682-8658-ecg-209-1-149-157.@@ Шрайнер Е.В., Хавкин А.И., Новикова М.С., Тикунов А.Ю., Чечушков А.В., Харахорин Р.А., Тикунова Н.В. Современные стратегии и перспективы лечения язвенного колита. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2023;209(1): 149-157. doi: 10.31146/1682-8658-ecg-209-1-149-157.

12. Schreiner E.B., Morozov V.V., Khavkin A.I., Vlasov V.V., Kulikov V.D., Koltsova S.T. The experience of the fecal microbiota transplantation in a patient with clostridial infection. Experimental and Clinical Gastroenterology. 2018;160(12): 80-83. (In Russ.) doi: 10.31146/1682-8658-ecg-160-12-80-83.@@ Шрайнер Е.В., Морозов В.В., Хавкин А.И., Власов В.В., Куликов В.Г., Кольцова С.Т. Опыт проведения трансплантации фекальной микробиоты у пациентки с клостридиальной инфекцией. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2018;160(12): 80-83. doi: 10.31146/1682-8658-ecg-160-12-80-83.

13. Khavkin A.I., Shrainer E.V., Denisov M. Yu., Derovs А.А., Gorelova Yu.S. Fecal microbiota transplantation in inflammatory bowel diseases in children: experience and perspectives. Vopr. prakt. pediatr. (Clinical Practice in Pediatrics). 2018; 13(3): 20-28. (In Russ.) doi: 10.20953/1817-7646-2018-3-20-28.@@ Хавкин А.И., Шрайнер Е.В., Денисов М.Ю., Деровс А.А., Горелова Ю.С. Трансплантация фекальной микрофлоры при воспалительных заболеваниях кишечника у детей: опыт и перспективы. Вопросы практической педиатрии. 2018; 13(3): 20-28. doi: 10.20953/1817-7646-2018-3-20-28.