Введение: Язвенная болезнь двенадцатиперстной кишки (ЯБ ДПК) является одним из наиболее часто встречающихся заболеваний желудочно-кишечного тракта с распространенностью 4-15%, возникает в 4 раза чаще по сравнению с язвенной болезнью желудка и поражает лиц от 30 до 55 лет. Вклад наследственных факторов в этиопатогенез заболевания составляет 5,5-50%. Цель исследования: Оценить роль SNP×SNP взаимодействий полиморфных локусов генов-кандидатов (rs2294008, rs505922, rs6136, rs8176720, rs2519093, rs507666, rs651007, rs579459, rs649129) в развитии язвенной болезни двенадцатиперстной кишки. Материалы и методы: Выборка составила 182 больных ЯБ ДПК и 347 индивидуумов контрольной группы, регуляторный потенциал полиморфных вариантов оценивался при помощи интернет-ресурсов, генотипирование проводилось методом ПЦР. Изучение интерлокусных взаимодействий полиморфных вариантов генов-кандидатов, ассоциированных с развитием ЯБ ДПК, проводилось с помощью модификации метода снижения размерности МDR (Multifactor Dimensionality Reduction) - Моdel-Based-МDR (MB-MDR), Визуализация данных осуществлялась в виде дендрограммы и графа с помощью программного обеспечения MDR (v. 3.0.2). Результаты: Шесть из 9 изученных SNPs в составе 5 значимых моделей интерлокусных взаимодействий участвуют в формировании ЯБ ДПК. В наибольшее количество моделей входят rs2294008 гена PSCA, rs8176720 и rs579459 гена АВО. Данные полиморфные варианты обладают выраженным регуляторным потенциалом во многих органах (тканях), в т. ч. в органах пищеварительной системы.