В современном мире пациент все чаще имеет коморбидную патологию. Сочетание у одного больного двух и/или более хронических состояний, патогенетически взаимосвязанных между собой или совпадающих по времени отягощают течение каждого отдельного заболевания. Заболевания почек часто ассоциированы с заболеваниями желудочно-кишечного тракта, сердечно сосудистой, эндокринной системы, имеют в основе единые иммунологические особенности этиологии и патогенеза. Хроническая болезнь почек (ХБП) у детей сопровождается необходимостью коррекции образа жизни с первых стадий болезни, осуществление контроля над физическим развитием ребенка. В процессе усугубления патологии, при стадии ХБП С4-С5 происходит нарушение гомеостаза, увеличивается концентрация токсических веществ в крови, наблюдаются изменения со стороны других органов и систем, в частности, со стороны органов желудочно-кишечного тракта. Мочевыделительная система и желудочно-кишечный тракт имеют общий план строения, функционирования и регуляции, что обуславливает общие механизмы этиологии и патогенеза. Наблюдается прямая корреляция между стадией ХБП и степенью поражения органов гастроинтестинальной системы. В данной статье рассмотрены патофизиологические механизмы поражения органов пищеварения на продвинутых стадиях ХБП С4-С5. Особое внимание уделено изменениям микробиоты желудочно-кишечного тракта, поскольку она в свою очередь влияет на течение системного воспаления, что является отягощающим фактором течения ХБП и может определять скорость прогрессирования заболевания. Акцент сделан на вовлечение гастроинтестинальной системы в той или иной степени у каждого ребенка с ХБП С4-С5.