nogrЭкспериментальная и клиническая гастроэнтерологияExperimental and Clinical Gastroenterology1682-8658«Global Media Technologies»10.31146/1682-8658-ecg-196-12-35-43nogr-1798Research ArticleКЛИНИЧЕСКАЯ ГАСТРОЭНТЕРОЛОГИЯCLINICAL GASTROENTEROLOGYТерапия синдрома раздраженного кишечника у жителей Вьетнама пробиотическими энтерококкамиIrritable bowel syndrome therapy in Vietnam with probiotic enterococcihttps://orcid.org/0000-0002-2569-6660ЕрмоленкоЕ. И.ErmolenkoE. I.

Ермоленко Елена Игоревна, д. м. н., заведующий лабораторией биомедицинской микроэкологии, отдел молекулярноймикробиологии, профессор кафедры медицинской микробиологии, СЗГМУ им. И. И. Мечникова

195067, Санкт-Петербург, Пискаревский пр., д. 47

Elena I. Ermolenko, PhD, MD (Medicine), Head, Laboratory of Biomedical Microecology; Professor, Faculty of Medical microbiology, Department of Medical Microbiology

195067, Saint Petersburg, Piskarevsky Ave, 47

lermolenko1@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0003-1073-6508КотылеваМ. П.KotylevaM. P.

Котылева Марина Петровна, научный сотрудник, отдел молекулярной микробиологии

197376, г. Санкт- Петербург, ул. Академика Павлова, 12

Maryna P. Kotyleva, Research Associate, Department of Molecular Microbiology

197376, St. Petersburg, Acad. Pavlov str., 12

https://orcid.org/0000-0001-7878-6339ЦапиеваА. Н.TsapievaA. N.

Цапиева Анна Николаевна, научный сотрудник, отдел молекулярной микробиологии

197376, г. Санкт- Петербург, ул. Академика Павлова, 12

Anna N. Tsapieva, Research Associate, Department of Molecular Microbiology

197376, St. Petersburg, Acad. Pavlov str., 12

КарасеваА. Б.KarasevaA. B.

Карасева Алена Борисовна, научный сотрудник, отдел молекулярной микробиологии

197376, г. Санкт- Петербург, ул. Академика Павлова, 12

Alena B. Karaseva, Research Associate, Department of Molecular Microbiology

197376, St. Petersburg, Acad. Pavlov str., 12

БуйТхи Лан АньBuiThi Lan An

Буй Тхи Лан Ань, научный сотрудник

Ханой

Bui Thi Lan Anh, Research Associate

Hanoi

https://orcid.org/0000-0003-2312-5589СуворовА. Н.SuvorovA. N.

Суворов Александр Николаевич, д. м. н., профессор, заведующий отделом молекулярной микробиологии; заведующий кафедрой фундаментальных проблем медицины и медицинской технологии СПБГМУ

197376, г. Санкт- Петербург, ул. Академика Павлова, 12199034, г. Санкт- Петербург, Университетская наб., 7/9

Alexander N. Suvorov, PhD, MD (Medicine), Professor, Chief of Department of Molecular Microbiology; head of the Department

197376, St. Petersburg, Acad. Pavlov str., 12199034, St Petersburg, Universitetskaya Emb., 7–9

Северо-Западный государственный медицинский университет имени И. И. МечниковаРоссияI. I. Mechnikov Northwestern State Medical UniversityRussian FederationФГБНУ «Институт экспериментальной медицины»РоссияFederal State Budgetary Scientifi c Institution “Institute of Experimental Medicine” (FSBRI “IEM”)Russian FederationСовместный Российско-Вьетнамский Тропический научно-исследовательский и технологический центр (Тропический центр)ВьетнамVietnam-Russia Tropical CentrViet NamФГБНУ «Институт экспериментальной медицины»; Санкт-Петербургский государственный университетРоссияFederal State Budgetary Scientifi c Institution “Institute of Experimental Medicine” (FSBRI “IEM”); Saint Petersburg State UniversityRussian Federation2021140120220123543Copyright © Ермоленко Е.И., Котылева М.П., Цапиева А.Н., Карасева А.Б., Буй Т., Суворов А.Н., 20222022Ермоленко Е.И., Котылева М.П., Цапиева А.Н., Карасева А.Б., Буй Т., Суворов А.Н.Ermolenko E.I., Kotyleva M.P., Tsapieva A.N., Karaseva A.B., Bui T., Suvorov A.N.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.nogr.org/jour/article/view/1798

В данной работе проведено сопоставление состава микробиоты кишечника здоровых волонтеров и больных синдромом раздраженного кишечника (СРК) жителей Ханоя до и после терапии пробиотической закваской на основе бактериоциногенного штамма Enterococcus faecium L3 (L3), успешно использующегося для коррекции дисбиоза и терапии СРК в России.

У больных СРК (группа IBS) α-разнообразие было выше, чем в контрольной группе (Нealthy) и у больных СРК после терапии пробиотиком (группа IBS+L3). Филогенетический анализ исследуемых образцов отразил разделение исследуемых сообществ на 2 кластера, в один из которых сгруппированы образцы, преимущественно взятые при СРК до терапии. Метод главных компонент (РСоА) показал, что большинство образцов из группы IBS локализуются на графике в отдельном секторе, отдаленном от расположенных рядом образцов IBS+L3 и Нealthy. Исследование микробиома вьетнамцев больных СРК после приема пробиотика на уровне типов (филов) выявило тенденцию к увеличению представительства Firmicutes. Введение L3 приводило к возрастанию популяции представителей семейства Lachnospiraceae, таких как бутират продуцирующие Roseburia и ацетат продуцирующие Blautia. В то же время снижалось процентное содержание стафилококков и бактерий относящихся к семейству Enterobacteriaceae. Помимо позитивных сдвигов в функционировании желудочно- кишечного тракта, выявленных на основе клинических данных, при помощи метагеномного анализа генов 16S рРНК выявлены особенности микробиоты кишечника у жителей Ханоя с СРК при сравнении со здоровыми волонтерами и у тех же больных после терапии пробиотиком.

Позитивные сдвиги в микробиоме кишечника больных СРК во Вьетнаме после терапии пробиотической закваской на основе L3 принципиально не отличаются от описанных ранее эффектов, отмеченных авторами при использовании данного пробиотика в России, что создает предпосылки для расширения возможности его использования в азиатском регионе.

In this work, we compared composition of the intestinal microbiota of healthy volunteers and patients with irritable bowel syndrome (IBS) in Hanoi residents before and after therapy with a probiotic starter culture based on the bacteriocinogenic strain Enterococcus faecium L3 (L3), which is successfully used to correct dysbiosis and treat IBS in Russia.In IBS patients (IBS group) α-diversity was higher than in the control group (Healthy) and in IBS patients after probiotic therapy (IBS + L3 group). Phylogenetic analysis of the studied samples refl ected the division of the studied communities into 2 clusters, one of which grouped samples, mainly taken for IBS before therapy. Principal component analysis (PCoA) showed that most of the samples from the IBS group are located on the graph in a separate sector, far from the adjacent IBS + L3 and Нealthy samples.A study of the microbiome of Vietnamese patients with IBS after taking probiotic at the level of types (phyls) revealed a tendency towards an increase in the representation of Firmicutes. The introduction of L3 led to an increase in the population of members of the family Lachnospiraceae, such as butyrate- producing Roseburia and acetate-producing Blautia. At the same time, the percentage of staphylococci and bacteria belonging to the Enterobacteriaceae family was decreased. In addition to positive changes in the functioning of the gastrointestinal tract, revealed on the basis of clinical data, the features of the intestinal microbiota of IBS residents of Hanoi compared with healthy volunteers and in the same patients after probiotic therapy were revealed by metagenomic analysis of 16S rRNA genes. Positive shifts in the intestinal microbiome of IBS patients in Vietnam after therapy with a probiotic starter culture based on L3 do not fundamentally diff er from the previously described eff ects noted by the authors when using this probiotic in Russia, which creates the preconditions for expanding the possibility of its use in the Asian region.

микробиотасиндромом раздраженного кишечникаEnterococcus faecium L3пробиотикиmicrobiotairritable bowel syndromeEnterococcus faecium L3probioticsReferencesСоловьева О. И., Симаненков В. И., Суворов А. Н., Ермоленко Е. И., Шумихина И. А., Свиридо Д. А. Использование пробиотиков и аутопробиотиков в лечении синдрома раздраженной толстой кишки. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология – 2017. – Т. 143, № 7. – С. 115–120.Solov’eva O.I., Simanenkov V. I., Suvorov A. N., Ermolenko E. I., Shumihina I. A., Svirido D. A. The use of probiotics and autoprobiotics in the treatment of irritable bowel syndrome. Experimental and Clinical Gastroenterology. 2017;(7):115–120. (In Russ.)Ивашкин В. Т., Шелыгин Ю. А., Баранская Е. К., и соавт. Клинические рекомендации Российской гастроэнтерологической ассоциации, Ассоциации колопроктологов России по диагностике и лечению больных с синдромом раздраженного кишечника. Рос. журн. гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. – 2014. – Т. 24, № 2. – C. 92–101.Ivashkin V.T., Shelygin Ju.A., Baranskaja E. K., et al. Russian Journal of Gastroenterology, Hepatology, Coloproctology. Clinical guidelines for the diagnosis and treatment of patients with irritable bowel syndrome. Russian Journal of Gastroenterology, Hepatology, Coloproctology. 2014; 24(2):92–101. (In Russ.)Xiong L. S., Chen M. H., Chen H. X., Xu A. G., Wang W. A., Hu P. J. A population-based epidemiologic study of irritable bowel syndrome in South China: stratifi ed randomized study by cluster sampling. Aliment. Pharmacol. Ther. 2004. Vol.19, pp.1217–1224. doi:10.1111/j.1365–2036.2004.01939.Xiong L. S., Chen M. H., Chen H. X., Xu A. G., Wang W. A., Hu P. J. A population-based epidemiologic study of irritable bowel syndrome in South China: stratifi ed randomized study by cluster sampling. Aliment. Pharmacol. Ther. 2004. Vol.19, pp.1217–1224. doi:10.1111/j.1365–2036.2004.01939.Chey W. D., Kurlander J., Eswaran, S. Irritable bowel syndrome: aclinical review. JAMA. 2015. Vol. 313, pp.949–958. doi:10.1001/jama.2015.0954.Chey W. D., Kurlander J., Eswaran, S. Irritable bowel syndrome: aclinical review. JAMA. 2015. Vol. 313, pp.949–958. doi:10.1001/jama.2015.0954.Zhuang X., Tian Z., Li L., Zeng Z., Chen M., Xiong L. Fecal Microbiota Alterations Associated With Diarrhea-Predominant Irritable Bowel Syndrome. Front. Microbiol. 2018. Vol. 25; 9:1600. doi:10.3389/fmicb.2018.01600. eCollection 2018.Zhuang X., Tian Z., Li L., Zeng Z., Chen M., Xiong L. Fecal Microbiota Alterations Associated With Diarrhea-Predominant Irritable Bowel Syndrome. Front. Microbiol. 2018. Vol. 25; 9:1600. doi:10.3389/fmicb.2018.01600. eCollection 2018.Quigley E. M., Fried M., Gwee K. A., et al.; Review Team:. World Gastroenterology Organisation Global Guidelines Irritable Bowel Syndrome: A Global Perspective Update September 2015. J Clin Gastroenterol. 2016; 50(9):704–13. doi:10.1097/MCG.0000000000000653.Quigley E. M., Fried M., Gwee K. A., et al.; Review Team:. World Gastroenterology Organisation Global Guidelines Irritable Bowel Syndrome: A Global Perspective Update September 2015. J Clin Gastroenterol. 2016; 50(9):704–13. doi:10.1097/MCG.0000000000000653.Liu H. N., Wu H., Chen Y. Z., Chen Y. J., Shen X. Z., Liu T. T. Altered molecular signature of intestinal microbiota in irritable bowel syndrome patients compared with healthy controls: A systematic review and meta-analysis. Dig Liver Dis. 2017; 49(4):331–337. doi:10.1016/j.dld.2017.01.142.Liu H. N., Wu H., Chen Y. Z., Chen Y. J., Shen X. Z., Liu T. T. Altered molecular signature of intestinal microbiota in irritable bowel syndrome patients compared with healthy controls: A systematic review and meta-analysis. Dig Liver Dis. 2017; 49(4):331–337. doi:10.1016/j.dld.2017.01.142.Ермоленко Е. И., Буй Т. Л. А., Карасева А. Б., Краева Л. А., Лавренова Н. С., Чан Т. Н., Богумильчик Е. А., Котылева М. П., Тан Н., Суворов А. Н. Характеристика энтерококков, выделенных из кишечника жителей Вьетнама и России при синдроме раздраженного кишечника. Гастроэнтерология Санкт-Петербурга. – 2017. – Т. 153. – С. 78–79.Ermolenko E. I., Bui T. L.A., Karaseva A. B., et al. Characteristics of enterococci isolated from the intestines of residents of Vietnam and Russia with irritable bowel syndrome. Gastroenterology of St. Petersburg. 2017, vol. 153, pp. 78–79. (In Russ.)Ermolenko E. I., Kudryavtsev I. V., Solovyova O. I., et al. Profile of subpopulation composition of regulatory T lymphocytes and intestinal microbiota in patients with irritable bowel syndrome. Medical Immunology (Russia). 2020; 22(2):335–346. doi:10.15789/1563–0625-POS-1905.Ermolenko E. I., Kudryavtsev I. V., Solovyova O. I., et al. Profile of subpopulation composition of regulatory T lymphocytes and intestinal microbiota in patients with irritable bowel syndrome. Medical Immunology (Russia). 2020; 22(2):335–346. doi:10.15789/1563–0625-POS-1905.Lee B. J., Bak Y. T. Irritable bowel syndrome, gut microbiota and probiotics. J Neurogastroenterol Motil. 2011; 17(3): 252–66. doi:10.5056/jnm.2011.17.3.252.Lee B. J., Bak Y. T. Irritable bowel syndrome, gut microbiota and probiotics. J Neurogastroenterol Motil. 2011; 17(3): 252–66. doi:10.5056/jnm.2011.17.3.252.Ford A. C., Harris L. A., Lacy B. E., Quigley E. M. M., Moayyedi P. Systematic review with meta-analysis: the efficacy of prebiotics, probiotics, synbiotics and antibiotics in irritable bowel syndrome. Aliment Pharmacol Ther. 2018; 48(10):1044–1060. doi:10.1111/apt.15001.Ford A. C., Harris L. A., Lacy B. E., Quigley E. M. M., Moayyedi P. Systematic review with meta-analysis: the efficacy of prebiotics, probiotics, synbiotics and antibiotics in irritable bowel syndrome. Aliment Pharmacol Ther. 2018; 48(10):1044–1060. doi:10.1111/apt.15001.Kim H. J., Vazquez Roque M. I., Camilleri M., Stephens D., Burton D. D., Baxter K., Thomforde G., Zinsmeister A. R. A randomized controlled trial of a probiotic combination VSL# 3 and placebo in irritable bowel syndrome with bloating. Neurogastroenterol Motil. 2005; 17(5):687–96. doi:10.1111/j.1365–2982.2005.00695.x.Kim H. J., Vazquez Roque M. I., Camilleri M., Stephens D., Burton D. D., Baxter K., Thomforde G., Zinsmeister A. R. A randomized controlled trial of a probiotic combination VSL# 3 and placebo in irritable bowel syndrome with bloating. Neurogastroenterol Motil. 2005; 17(5):687–96. doi:10.1111/j.1365–2982.2005.00695.x.Simrén M., Ohman L., Olsson J., Svensson U., Ohlson K., Posserud I., Strid H. Clinical trial: the effects of a fermented milk containing three probiotic bacteria in patients with irritable bowel syndrome – a randomized, double-blind, controlled study. Aliment Pharmacol Ther. 2010; 31(2):218–27. doi:10.1111/j.1365–2036.2009.04183.x.Simrén M., Ohman L., Olsson J., Svensson U., Ohlson K., Posserud I., Strid H. Clinical trial: the effects of a fermented milk containing three probiotic bacteria in patients with irritable bowel syndrome – a randomized, double-blind, controlled study. Aliment Pharmacol Ther. 2010; 31(2):218–27. doi:10.1111/j.1365–2036.2009.04183.x.Suvorov A. What Is Wrong with Enterococcal Probiotics? Probiotics Antimicrob Proteins. 2020; 12(1):1–4. doi:10.1007/s12602–020–09633-y.Suvorov A. What Is Wrong with Enterococcal Probiotics? Probiotics Antimicrob Proteins. 2020; 12(1):1–4. doi:10.1007/s12602–020–09633-y.Suvorov А., Ermolenko E., Alechina G., Chernysh A., Karaseva A., Pierro F. Di. Enterococcus as probiotics: what is the advantage? Nutrafoods. 2019; 1:17–25. doi:10.17470/NF-019–0003.Suvorov А., Ermolenko E., Alechina G., Chernysh A., Karaseva A., Pierro F. Di. Enterococcus as probiotics: what is the advantage? Nutrafoods. 2019; 1:17–25. doi:10.17470/NF-019–0003.DeSantis T.Z., Hugenholtz Р., Larsen N., et al. Greengenes, a chimera-checked 16S rRNA gene database and workbench compatible with ARB. Appl Environ Microbiol. 2006; 72(7):5069–72. doi:10.1128/AEM.03006–05.DeSantis T.Z., Hugenholtz Р., Larsen N., et al. Greengenes, a chimera-checked 16S rRNA gene database and workbench compatible with ARB. Appl Environ Microbiol. 2006; 72(7):5069–72. doi:10.1128/AEM.03006–05.McMurdie P.J., Holmes S. Phyloseq: an R package for reproducible interactive analysis and graphics of microbiome census data. PLoS One. 2013; 22; 8(4): e61217. doi:10.1371/journal.pone.0061217.McMurdie P.J., Holmes S. Phyloseq: an R package for reproducible interactive analysis and graphics of microbiome census data. PLoS One. 2013; 22; 8(4): e61217. doi:10.1371/journal.pone.0061217.Алехина Г. Г., Суворов А. Н. Штамм энтерококков Enterococcus faecium l-3 для изготовления лечебно-профилактических средств и продуктов питания лечебно-профилактического назначения. Патент № 2220199, 2002.Alekhina G. G., Suvorov А. N. Enterococcus strain Entero coccus faecium l-3 for preparing curativeprophylactic agents and foodstuffs of curativeprophylactic designation. Patent № 2220199, 2002. (In Russ.)Ermolenko E. I., Svirido D. A., Kotyleva M. P., Karaseva A. B., Simanenkov V. I., Suvorov A. N. Usage of indigenous enterococcus for the experimental irritable bowel syndrome treatment. [International Human Microbiome Consortium Congress]. Kaunas, 2016.Ermolenko E. I., Svirido D. A., Kotyleva M. P., Karaseva A. B., Simanenkov V. I., Suvorov A. N. Usage of indigenous enterococcus for the experimental irritable bowel syndrome treatment. [International Human Microbiome Consortium Congress]. Kaunas, 2016.Abdurasulova I. N., Matsulevich A. V., Tarasova E. A., et al. Enterococcus faecium strain L-3 and glatiramer acetate ameliorate experimental allergic encephalomyelitis in rats by affecting different populations of immune cells. Benef Microbes. 2016; 7(5):719–729. doi:10.3920/BM2016.0018.Abdurasulova I. N., Matsulevich A. V., Tarasova E. A., et al. Enterococcus faecium strain L-3 and glatiramer acetate ameliorate experimental allergic encephalomyelitis in rats by affecting different populations of immune cells. Benef Microbes. 2016; 7(5):719–729. doi:10.3920/BM2016.0018.Miliukhina I., Ermolenko E., Ivanova A., Kotyleva M., Suvorov A. Probiotic correction of intestinal dysbiosis in Parkinson’s disease [abstract]. Mov Disord. 2017; 32 (suppl 2). https://www.mdsabstracts.org/abstract/probiotic-correction-of-intestinal-dysbiosis-inparkinsons-disease/.Miliukhina I., Ermolenko E., Ivanova A., Kotyleva M., Suvorov A. Probiotic correction of intestinal dysbiosis in Parkinson’s disease [abstract]. Mov Disord. 2017; 32 (suppl 2). https://www.mdsabstracts.org/abstract/probiotic-correction-of-intestinal-dysbiosis-inparkinsons-disease/.Ермоленко E. И., Милюхина И. В., Цапиева А. Н., Алехина Г. Г., Истомина А. С., Грачева Е. В., Котылева М. П., Суворов А. Н. Способ уменьшения выраженности немоторных симптомов у пациентов, страдающих болезнью Паркинсона. Патент RU2734718C1, 2019.Ermolenko E. I., Milyukhina I. V., Tsapieva A. N., et al. Method of reducing manifestation of non-motor symptoms in patients with parkinson’s disease. Patent RU2734718C1, 2019. (In Russ.)Ермоленко Е. И., Котылева М. П., Буй Тхи Лан Ань, и Соавт. Исследование микробиоты кишечника жителей Вьетнама и России. Journal of Tropical Science and Technology. –2016. –№ 12.–Р. 24–35. ISSN: 0866–753512.Ermolenko E.I., Kotyleva M. P., Bui Thi Lan An, et al. Research of the intestinal microbiota of residents of Vietnam and Russia. Journal of Tropical Science and Technology. 2016; 12:24–35. ISSN: 0866–753512.Ермоленко Е. И., Ерофеев Н. П., Захарова Л. Б., Парийская Е. Н., Котылева М. П., Крамская Т. А., Карасева А. Б., Суворов А. Н. Особенности состава микробиоты и моторики кишечника после коррекции экспериментального дисбиоза пробиотическими и аутопробиотическими энтерококками. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. – 2017. – № 7. – С. 89–96.Ermolenko E. I., Erofeev N. P., Zacharova L. B., et al. Features of microbiota content and intestinal motility after the correction of experimental dysbiosis with probiotic and autoprobiotic enterococci. Experimental and Clinical Gastroenterology. 2017; (7):89–96. (In Russ.)Ermolenko E., Gromova L., Borschev Yu., et al. Influence of different probiotic lactic Acid bacteria on microbiota and metabolism of rats with dysbiosis. Biosci Microbiota Food Health. 2013; 32(2):41–9. doi:10.12938/bmfh.32.41.Ermolenko E., Gromova L., Borschev Yu., et al. Influence of different probiotic lactic Acid bacteria on microbiota and metabolism of rats with dysbiosis. Biosci Microbiota Food Health. 2013; 32(2):41–9. doi:10.12938/bmfh.32.41.Saulnier D. M., Riehle K., Mistretta T., et al. Gastrointestinal microbiome signatures of pediatric patients with irritable bowel syndrome. Gastroenterology. 2011; 141(5):1782–91. doi:10.1053/j.gastro.2011.06.072.Saulnier D. M., Riehle K., Mistretta T., et al. Gastrointestinal microbiome signatures of pediatric patients with irritable bowel syndrome. Gastroenterology. 2011; 141(5):1782–91. doi:10.1053/j.gastro.2011.06.072.Zheng J., Wittouck S., Salvetti E., et al. A taxonomic note on the genus Lactobacillus: Description of 23 novel genera, emended description of the genus Lactobacillus Beijerinck 1901, and union of Lactobacillaceae and Leucono stocaceae. Int J Syst Evol Microbiol. 2020; 70(4):2782–2858. doi:10.1099/ijsem.0.004107.Zheng J., Wittouck S., Salvetti E., et al. A taxonomic note on the genus Lactobacillus: Description of 23 novel genera, emended description of the genus Lactobacillus Beijerinck 1901, and union of Lactobacillaceae and Leucono stocaceae. Int J Syst Evol Microbiol. 2020; 70(4):2782–2858. doi:10.1099/ijsem.0.004107.Suvorov A., Karaseva A., Kotyleva M., et al. Auto probiotics as an Approach for Restoration of Personalised Microbiota. Front Microbiol. 2018; 9:1869. doi:10.3389/fmicb.2018.01869.Suvorov A., Karaseva A., Kotyleva M., et al. Auto probiotics as an Approach for Restoration of Personalised Microbiota. Front Microbiol. 2018; 9:1869. doi:10.3389/fmicb.2018.01869.Le Chatelier E., Nielsen T., Qin J., Prift i E., Hildebrand F., Falony G., Almeida M., Arumugam M., Batto J. M., Kennedy S., Leonard P., Li J., Burgdorf K., Grarup N., Jørgensen T., Brandslund I., Nielsen H. B., Juncker A. S., Bertalan M., Levenez F., Pons N., Rasmussen S., Sunagawa S., Tap J., Tims S., Zoetendal E. G., Brunak S., Clément K., Doré J., Kleerebezem M., Kristiansen K., Renault P., Sicheritz-Ponten T., de Vos W. M., Zucker J. D., Raes J., Hansen T.; MetaHIT consortium, Bork P., Wang J., Ehrlich S. D., Pedersen O. Richness of human gut microbiome correlates with metabolic markers. Nature. 2013; 500(7464):541–6. doi:10.1038/nature12506.Le Chatelier E., Nielsen T., Qin J., Prift i E., Hildebrand F., Falony G., Almeida M., Arumugam M., Batto J. M., Kennedy S., Leonard P., Li J., Burgdorf K., Grarup N., Jørgensen T., Brandslund I., Nielsen H. B., Juncker A. S., Bertalan M., Levenez F., Pons N., Rasmussen S., Sunagawa S., Tap J., Tims S., Zoetendal E. G., Brunak S., Clément K., Doré J., Kleerebezem M., Kristiansen K., Renault P., Sicheritz-Ponten T., de Vos W. M., Zucker J. D., Raes J., Hansen T.; MetaHIT consortium, Bork P., Wang J., Ehrlich S. D., Pedersen O. Richness of human gut microbiome correlates with metabolic markers. Nature. 2013; 500(7464):541–6. doi:10.1038/nature12506.Duncan S. H., Hold G. L., Barcenilla A., Stewart C. S., Flint H. J. Roseburia intestinalis sp. nov., a novel saccharolytic, butyrate-producing bacterium from human faeces. Int J Syst Evol Microbiol. 2002; 52(Pt 5):1615–1620. doi:10.1099/00207713–52–5–1615.Duncan S. H., Hold G. L., Barcenilla A., Stewart C. S., Flint H. J. Roseburia intestinalis sp. nov., a novel saccharolytic, butyrate-producing bacterium from human faeces. Int J Syst Evol Microbiol. 2002; 52(Pt 5):1615–1620. doi:10.1099/00207713–52–5–1615.Marchesi J. R., Dutilh B. E., Hall N., Peters W. H., Roelofs R., Boleij A., Tjalsma H. Towards the human colorectal cancer microbiome. PLoS One. 2011; 6(5): e20447. doi:10.1371/journal.pone.0020447.Marchesi J. R., Dutilh B. E., Hall N., Peters W. H., Roelofs R., Boleij A., Tjalsma H. Towards the human colorectal cancer microbiome. PLoS One. 2011; 6(5): e20447. doi:10.1371/journal.pone.0020447.Rajilić-Stojanović M., Jonkers D. M., Salonen A., et al. Intestinal microbiota and diet in IBS: causes, consequences, or epiphenomena? Am J Gastroenterol. 2015; 110(2):278–87. doi:10.1038/ajg.2014.427.Rajilić-Stojanović M., Jonkers D. M., Salonen A., et al. Intestinal microbiota and diet in IBS: causes, consequences, or epiphenomena? Am J Gastroenterol. 2015; 110(2):278–87. doi:10.1038/ajg.2014.427.Вахитов Т. Я., Ситкин С. И., Концепция суперорганизма в биологии и медицине. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. – 2014. – Т. 107, № 7. – С. 72–85.Vakhitov T. Ia., Sitkin S. I. [The superorganism concept in biology and medicine]. Eksp Klin Gastroenterol. 2014; 107(7):72–85. PMID:25842410. (In Russ.)Bernalier A., Willems A., Leclerc M., Rochet V., Collins M. D. Ruminococcus hydrogenotrophicus sp. nov., a new H2/CO2-utilizing acetogenic bacterium isolated from human feces. Arch Microbiol. 1996; 166(3):176–83. doi:10.1007/s002030050373.Bernalier A., Willems A., Leclerc M., Rochet V., Collins M. D. Ruminococcus hydrogenotrophicus sp. nov., a new H2/CO2-utilizing acetogenic bacterium isolated from human feces. Arch Microbiol. 1996; 166(3):176–83. doi:10.1007/s002030050373.Rey F. E., Faith J. J., Bain J., Muehlbauer M. J., Stevens R. D., Newgard C. B., Gordon J. I. Dissecting the in vivo metabolic potential of two human gut acetogens. J Biol Chem. 2010; 285(29):22082–90. doi:10.1074/jbc.M110.117713.Rey F. E., Faith J. J., Bain J., Muehlbauer M. J., Stevens R. D., Newgard C. B., Gordon J. I. Dissecting the in vivo metabolic potential of two human gut acetogens. J Biol Chem. 2010; 285(29):22082–90. doi:10.1074/jbc.M110.117713.Ушкалова Е. А. Роль пробиотиков в гастроэнтерологии. Фарматека. – 2007. – № 6. – С. 18–25.Ushkalova E. A. The Role of Probiotics in Gastroenterology. Pharmateka. 2007; 6:18–25. (In Russ.)Drouault-Holowacz S., Bieuvelet S., Burckel A., Cazaubiel M., Dray X., Marteau P. A double blind randomized controlled trial of a probiotic combination in 100 patients with irritable bowel syndrome. Gastroenterol Clin Biol. 2008; 32(2):147–52. doi:10.1016/j.gcb.2007.06.001.Drouault-Holowacz S., Bieuvelet S., Burckel A., Cazaubiel M., Dray X., Marteau P. A double blind randomized controlled trial of a probiotic combination in 100 patients with irritable bowel syndrome. Gastroenterol Clin Biol. 2008; 32(2):147–52. doi:10.1016/j.gcb.2007.06.001.Enck P., Zimmermann K., Menke G., Klosterhalfen S. Randomized controlled treatment trial of irritable bowel syndrome with a probiotic E.-coli preparation (DSM17252) compared to placebo. Z Gastroenterol. 2009; 47(2):209–14. doi:10.1055/s-2008–1027702.Enck P., Zimmermann K., Menke G., Klosterhalfen S. Randomized controlled treatment trial of irritable bowel syndrome with a probiotic E.-coli preparation (DSM17252) compared to placebo. Z Gastroenterol. 2009; 47(2):209–14. doi:10.1055/s-2008–1027702.Kajander K., Myllyluoma E., Rajilic-Stojanovic M., et al. Clinical trial: multispecies probiotic supplementation alleviates the symptoms of irritable bowel syndrome and stabilizes intestinal microbiota. Aliment Pharmacol Th er. 2008; 27(1):48–57. doi:10.1111/j.1365–2036.2007.03542.x.Kajander K., Myllyluoma E., Rajilic-Stojanovic M., et al. Clinical trial: multispecies probiotic supplementation alleviates the symptoms of irritable bowel syndrome and stabilizes intestinal microbiota. Aliment Pharmacol Th er. 2008; 27(1):48–57. doi:10.1111/j.1365–2036.2007.03542.x.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.