nogrЭкспериментальная и клиническая гастроэнтерологияExperimental and Clinical Gastroenterology1682-8658«Global Media Technologies»10.31146/1682-8658-ecg-193-9-73-77nogr-1739Research ArticleКЛИНИЧЕСКАЯ ГАСТРОЭНТЕРОЛОГИЯCLINICAL GASTROENTEROLOGYМорфологическая, ультраструктурная и яркостная количественная характеристика электронномикроскопических изображений Helicobacter pyloriMorphological, ultrastructural and brightness quantitative characteristics of Helicobacter pylori electronic microscopic imageshttps://orcid.org/0000-0002-4653-2446ЖуховицкийВ. Г.ZhukhovitskyV. G.

Жуховицкий Владимир Григорьевич - кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник, заведующий лабораторией индикации и ультраструктурного анализа микроорганизмов; доцент кафедры биохимии и иммунопатологии.

Москва, ул. Гамалеи, д. 18, 123098; Москва, ул. Баррикадная, д. 2/1, стр. 1, 125993

Vladimir G. Zhukhovitsky - MD, PhD, Head of the Laboratory of indication and ultrastructural analysis of microorganisms, Scopus Author ID: 57194386794, WoS ID: AAH-9536–2020.

Moscow, Gamaleya str., h. 18, 123098; Moscow, Barrikadnaya str., h. 2/1, build. 1, 125993

zhukhovitsky@rambler.ruhttps://orcid.org/0000-0002-8470-582XНавольневС. О.NavolnevS. O.

Кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории индикации и ультраструктурного анализа микроорганизмов.

Москва, ул. Гамалеи, д. 18, 123098

MD, PhD, Senior Scientist of the Laboratory of indication and ultrastructural analysis of microorganisms.

Moscow, Gamaleya str., h. 18, 123098

https://orcid.org/0000-0001-9651-1654ШевлягинаН. В.ShevlyaginaN. V.

Кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории индикации и ультраструктурного анализа микроорганизмов.

Москва, ул. Гамалеи, д. 18, 123098

MD, PhD, Senior Scientist of the Laboratory of indication and ultrastructural analysis of microorganisms.

Moscow, Gamaleya str., h. 18, 123098

ФГБУ Национальный исследовательский Центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи Минздрава РФ; Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования (РМАНПО) Минздрава РФРоссияGamaleya National Research Centre for Epidemiology & Microbiology of the Ministry of Public Health; Russian Medical Academy of Continuing Professional Education (RMANPO), Ministry of Public HealthRussian FederationФГБУ Национальный исследовательский Центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи Минздрава РФРоссияGamaleya National Research Centre for Epidemiology & Microbiology of the Ministry of Public HealthRussian Federation202110122021097377Copyright © Жуховицкий В.Г., Навольнев С.О., Шевлягина Н.В., 20212021Жуховицкий В.Г., Навольнев С.О., Шевлягина Н.В.Zhukhovitsky V.G., Navolnev S.O., Shevlyagina N.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.nogr.org/jour/article/view/1739

С помощью оригинальной компьютерной программы выполнена количественная характеристика структурных особенностей культур двух эталонных штаммов Helicobacter pylori, выявленных посредством трансмиссионной электронной микроскопии. Полученные результаты позволили установить морфологические, ультраструктурные и яркостные различия между отдельными бактериальными клетками исследованных штаммов. Предложенная программа, составленная в соответствие с требованиями технологии компьютерного зрения, позволяет обнаруживать различия в структуре бактериальных клеток, невыявляемые при визуальной оценке, а также открывает возможность изучения фенотипической гетерогенности изогенных популяций Helicobacter pylori и её патогенетического значения.

Using an original computer program, a quantitative characteristic of the structural features of the cultures of two reference strains of Helicobacter pylori, identified by transmission electron microscopy, was performed. The results obtained made it possible to establish morphological, ultrastructural and brightness differences between individual bacterial cells of the studied strains. The proposed program, compiled in accordance with the requirements of computer vision technology, makes it possible to detect differences in the structure of bacterial cells that are not detected by visual assessment, and also opens up the possibility of studying the phenotypic heterogeneity of isogenic populations of Helicobacter pylori and its pathogenic significance.

Helicobacter pyloriэлектронная микроскопиякомпьютерное зрениеHelicobacter pylorielectron microscopycomputer visionReferencesLeja M., Grinberga-Derica I., Bilgilier C., Steininger C. Review: epidemiology of Helicobacter pylori infection. Helicobacter. 2019, No. 24, Suppl. 1: e12635. DOI: 10.1111/hel.12635.Leja M., Grinberga-Derica I., Bilgilier C., Steininger C. Review: epidemiology of Helicobacter pylori infection. Helicobacter. 2019, No. 24, Suppl. 1: e12635. DOI: 10.1111/hel.12635.Chmiela M., Kupcinskas J. Pathogenesis of Helicobacter pylori infection. Helicobacter. 2019, No. 24, Suppl. 1: e12638. DOI: 10.1111/hel.12638.Chmiela M., Kupcinskas J. Pathogenesis of Helicobacter pylori infection. Helicobacter. 2019, No. 24, Suppl. 1: e12638. DOI: 10.1111/hel.12638.Amieva M., Peek R. M. Pathobiology of Helicobacter pylori-induced gastric cancer. Gastroenterology. 2016;150(1):64-78. DOI: 10.1053/j.gastro.2015.09.004.Amieva M., Peek R. M. Pathobiology of Helicobacter pylori-induced gastric cancer. Gastroenterology. 2016;150(1):64-78. DOI: 10.1053/j.gastro.2015.09.004.Harris J. R. Transmission electron microscopy in molecular structural biology: a historical survey. Arch. Biochem. Biophys. 2015, Vol. 581, pp. 3-18. DOI: 10.1016/j.abb.2014.11.011.Harris J. R. Transmission electron microscopy in molecular structural biology: a historical survey. Arch. Biochem. Biophys. 2015, Vol. 581, pp. 3-18. DOI: 10.1016/j.abb.2014.11.011.Шапиро Л., Стокман Дж. Компьютерное зрение (пер. с англ.). - М: “БИНОМ - Лаборатория знаний”. - 2006. - 752 с.Shapiro L., Stockman J. Computer vision (translated from English). Moscow. “BINOM - Knowledge Laboratory”. 2006, 752 p. (In Russ)Диденко Л. В., Навольнев С. О. Программа для анализа биологических микрообъектов на изображениях, полученных от электронного микроскопа // Научная сессия НИЯУ МИФИ-2012, том 1. Инновационные ядерные технологии. Высокие технологии в медицине. - М: НИЯУ МИФИ. - 2012. - С. 286.Didenko L.V., Navolnev S. O. A program for the analysis of biological micro-objects in images obtained from an electron microscope. Scientific session of NRNU MEPhI-2012, volume 1. Innovative nuclear technologies. High technologies in medicine. Moscow. NRNU MEPhI Publ. 2012, 286 P.Жуховицкий В. Г., Смирнова Т. А., Шевлягина Н. В., Коржева И. Ю., Диденко Л. В., Гинцбург А. Л. Биоплёнка Helicobacter pylori in vitro и in vivo // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. - 2017. - № 5 - С. 14-19. DOI: 10.31146/1682-8658-ecg-141-5-14-19.Zhukhovitsky V.G., Smirnova T. A., Shevlyagina N. V., Korzheva I. Yu., Didenko L. V., Gintsburg A. L. Helicobacter pylori BIOFILM IN VITRO AND IN VIVO. Experimental and Clinical Gastroenterology. 2017;(5):14-19. (In Russ.) DOI: 10.31146/1682-8658-ecg-141-5-14-19.Tizro P., Choi C., Khanlou N. Sample preparation for transmission electron microscopy. Methods Mol. Biol. 2019, Vol. 1897, pp. 417-424. DOI: 10.1007/978-1-4939-8935-5_33.Tizro P., Choi C., Khanlou N. Sample preparation for transmission electron microscopy. Methods Mol. Biol. 2019, Vol. 1897, pp. 417-424. DOI: 10.1007/978-1-4939-8935-5_33.Навольнев С. О. Разработка компьютерной программы для количественной оценки цифрового изображения бактерий, полученного от трансмиссионного электронного микроскопа // Бактериология. - 2017. - № 2. - С. 20-23. DOI: 10.20953/2500-1027-2017-2-20-23.Navolnev S. O. Development of a computer program for quantitative assessment of the digital image of bacteria obtained from a transmission electron microscope. Bacteriology. 2017;2(2):20-23. DOI: 10.20953/2500-1027-2017-2-20-23.Ackermann M. A functional perspective on phenotypic heterogeneity in microorganisms. Nat. Rev. Microbiol. 2015;13(8):497-508. Doi: 10.1038/nrmicro3491.Ackermann M. A functional perspective on phenotypic heterogeneity in microorganisms. Nat. Rev. Microbiol. 2015;13(8):497-508. Doi: 10.1038/nrmicro3491.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.