nogrЭкспериментальная и клиническая гастроэнтерологияExperimental and Clinical Gastroenterology1682-8658«Global Media Technologies»10.31146/1682-8658-ecg-190-6-12-17nogr-1671Research ArticleCOVID-19COVID-19Острый гастроэнтерит при новой коронавирусной инфекции у жителей НовосибирскаAcute gastroenteritis with a new coronavirus infection in Novosibirsk residentshttps://orcid.org/0000-0003-2625-5442КрасноваЕ. И.KrasnovaE. I.

Краснова Елена Игоревна, д. м. н., профессор, заведующая кафедрой инфекционных болезней

630091 Новосибирск, Россия

Elena I. Krasnova, Doctor of Medical Sciences, Professor, Head of the Department of Infectious Diseases

630091 Novosibirsk, Krasniy prospekt, 52

krasnova-inf@rambler.ruhttps://orcid.org/0000-0002-3475-9934ПровороваВ. В.ProvorovaV. V.

Проворова Вероника Валерьевна, к. м. н., доцент кафедры инфекционных болезней

630091 Новосибирск, Россия

Veronika V. Provorova, Candidate of Medical Sciences, Associate Professor of the Department of Infectious Diseases

630091 Novosibirsk, Krasniy prospekt, 52

ХохловаН. И.KhokhlovaN. I.

Хохлова Наталья Игоревна, к. м. н., доцент кафедры инфекционных болезней

630091 Новосибирск, Россия

Natalia I. Khokhlova, Candidate of Medical Sciences, Associate Professor of the Department of Infectious Diseases

630091 Novosibirsk, Krasniy prospekt, 52

БородинаЕ. В.BorodinaE. V.

Бородина Екатерина Владимировна, ассистент кафедры инфекционных болезней

630091 Новосибирск, Россия

Ekaterina V. Borodina, Assistant of the Department of Infectious Diseases

630091 Novosibirsk, Krasniy prospekt, 52

ШероноваО. Б.SheronovaO. B.

Шеронова Ольга Борисовна, заведующая отделением кишечных инфекций

630099, Новосибирск, Россия

Olga B. Sheronova, Head of the Department of Intestinal Infections

Novosibirsk, 630099, Russia

ТикуноваН. В.TikunovaN. V.

Тикунова Нина Викторовна, доктор биологических наук, главный научный сотрудник, заведующая лабораторией молекулярной биологии

630090, Новосибирск, Россия

Nina V. Tikunova, Doctor of Biological Sciences, Chief Researcher, Head of the Laboratory of Molecular Biology

630090, Novosibirsk, Russia

КузнецоваВ. Г.KuznetsovaV. G.

Кузнецова Вера Гаврииловна, д. м. н., профессор кафедры инфекционных болезней

630091 Новосибирск, Россия

Vera G. Kuznetsova, Doctor of Medical Sciences, Professor of the Department of Infectious Diseases

630091 Novosibirsk, Krasniy prospekt, 52

КуимоваИ. В.KuimovaI. V.

Куимова Ирина Валентиновна, д. м. н., профессор кафедры инфекционных болезней

630091 Новосибирск, Россия

Irina V. Kuimova, Doctor of Medical Sciences, Professor of the Department of Infectious Diseases

630091 Novosibirsk, Krasniy prospekt, 52

ИзвековаИ. Я.IzvekovaI. Ya.

Извекова Ирина Яковлевна, д. м. н., профессор кафедры инфекционных болезней

630091 Новосибирск, Россия

Irina Ya. Izvekova, Doctor of Medical Sciences, Professor of the Department of Infectious Diseases

630091 Novosibirsk, Krasniy prospekt, 52

ПанасенкоЛ. М.PanasenkoL. M.

Панасенко Людмила Михайловна, д. м. н., профессор кафедры пропедевтики детских болезней

630091 Новосибирск, Россия

Lyudmila M. Panasenko, Doctor of Medical Sciences, Professor of the Department of Propaedeutics of Children’s Diseases

630091 Novosibirsk, Krasniy prospekt, 52

ПомогаеваА. П.PomogaevaA. P.

Помогаева Альбина Петровна, д. м. н., профессор кафедры детских болезней

Томск, Россия

Albina P. Pomogaeva, Doctor of Medical Sciences, Professor of the Department of Propaedeutics of Children’s Diseases

Tomsk, Russia

ЛукашоваЛ. В.LukashovaL. V.

Лукашова Лариса Владимировна, д. м. н., профессор, заведующий кафедрой инфекционных болезней и эпидемиологии

Томск, Россия

Larisa V. Lukashova, Doctor of Medical Sciences, Professor, Head of the Department of Infectious Diseases and Epidemiology

Tomsk, Russia

ЕвстроповА. Н.EvstropovA. N.

Евстропов Александр Николаевич, д. м. н., профессор кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии

630091 Новосибирск, Россия

Alexander N. Evstropov, Doctor of Medical Sciences, Professor of the Department of Microbiology, Virology and Immunology

630091 Novosibirsk, Krasniy prospekt, 52

Новосибирский государственный медицинский университет МЗ РФРоссияNovosibirsk State Medical University of the Ministry of Health of the Russian FederationRussian FederationГородская инфекционная клиническая больница № 1РоссияCity Infectious Diseases Clinical Hospital No. 1Russian FederationФГБУН Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАНРоссияFGBUN Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine SB RASRussian FederationФГБОУ ВО «Сибирский государственный медицинский университет» Минздрава РоссииРоссияSiberian State Medical University, Ministry of Health of the Russian FederationRussian Federation202131082021161217Copyright © Краснова Е.И., Проворова В.В., Хохлова Н.И., Бородина Е.В., Шеронова О.Б., Тикунова Н.В., Кузнецова В.Г., Куимова И.В., Извекова И.Я., Панасенко Л.М., Помогаева А.П., Лукашова Л.В., Евстропов А.Н., 20212021Краснова Е.И., Проворова В.В., Хохлова Н.И., Бородина Е.В., Шеронова О.Б., Тикунова Н.В., Кузнецова В.Г., Куимова И.В., Извекова И.Я., Панасенко Л.М., Помогаева А.П., Лукашова Л.В., Евстропов А.Н.Krasnova E.I., Provorova V.V., Khokhlova N.I., Borodina E.V., Sheronova O.B., Tikunova N.V., Kuznetsova V.G., Kuimova I.V., Izvekova I.Y., Panasenko L.M., Pomogaeva A.P., Lukashova L.V., Evstropov A.N.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.nogr.org/jour/article/view/1671

Цель исследования — определение частоты и клинико- лабораторных особенностей острого гастроэнтерита (ОГЭ) у взрослых жителей Новосибирска, госпитализированных с новой коронавирусной инфекцией (СОVID-19) в 2020 г.

Материалы и методы

Материалы и методы. Обследованы 3581 пациентов в возрасте от 18 до 96 лет с диагнозом «Новая коронавирусная инфекция», подтвержденным выявлением РНК SARS-CоV 2 в слизи из рото-носоглотки методом ПЦР, госпитализированных в ГБУЗ НСО ГИКБ № 1 в 2020 г. Наряду с общепринятыми методами диагностики у 50 больных с гастроинтестинальным синдромом исследовались фекалии методом ПЦР для выявления РНК SARS-CоV-2 с использованием набора оригинальных специфических праймеров.

Результаты

Результаты. Из числа 3581 госпитализированных взрослых больных COVID-19 в 74% случаев диагностирована двусторонняя полисегментарная пневмония, в 26% случаях заболевание протекало как острая респираторная инфекция. Проявления ОГЭ наблюдались у 6,8% (n=243) больных. В группе 50 больных COVID-19, у которых заболевание начиналось с симптомов ОГЭ, он выходил на первый план в клинической картине заболевания в 20% случаев, и РНК SARS-Co- V2 в фекалиях была выявлена у 62% больных.

Заключение

Заключение. Установленная частота ОГЭ при COVID-19 у взрослых показывает необходимость разработки и внедрения в клиническую практику тест-систем (ПЦР РНК SARS-CоV-2 в фекалиях) для диагностики кишечной формы новой коронавирусной инфекции.

The aim of the study was to determine the frequency and clinical and laboratory features of acute gastroenteritis (OGE) in adult residents of Novosibirsk hospitalized with a new coronavirus infection (COVID-19) in 2020.

Materials and methods

Materials and methods. We examined 3581 patients aged 18 to 96 years with a diagnosis of “New coronavirus infection”, confirmed by the detection of SARS-CoV-2 RNA in the mucus from the oropharynx by PCR, hospitalized in the State Medical Institution NSO GICB No. 1 in 2020. Along with the generally accepted diagnostic methods, feces were examined by PCR in 50 patients with gastrointestinal syndrome to detect SARS-CoV-2 RNA using a set of original specific primers.

Results

Results. Of the 3,581 hospitalized adult patients with COVID-19, 74% of cases were diagnosed with bilateral polysegmental pneumonia, and 26% of cases were diagnosed with acute respiratory infection. Manifestations of OGE were observed in 6.8% (n=243) of patients. In the group of 50 COVID-19 patients, in whom the disease began with symptoms of OGE, it came to the fore in the clinical picture of the disease in 20% of cases, and SARS-Co- V2 RNA in the feces was detected in 62% of patients.

Conclusion The established frequency of OGE in COVID-19 in adults shows the need to develop and implement in clinical practice test systems (PCR of SARS-CoV-2 RNA in feces) for the diagnosis of the intestinal form of a new coronavirus infection.

новая коронавирусная инфекцияCOVID-19SARS-CоV-2гастроинтестинальный синдромострый гастроэнтеритполимеразная цепная реакцияcoronavirus infectionCOVID-19SARS-CoV-2gastrointestinal syndromeacute gastroenteritispolymerase chain reactionReferencesВременные методические рекомендации «Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (COVID-19)». Министерство здравоохранений Российской федерации. – 2021 – v.10. – 261 с.Temporary guidelines “Prevention, diagnosis and treatment of new coronavirus infection (COVID-19)”. Ministry of Health of the Russian Federation. 2021, v. 10, 261 p. (in Russ.)Никифоров В. В., Суранова Т. Г., Чернобровкина Т. Я., и соавт. Новая коронавирусная инфекция (Covid-19): клинико- эпидемиологические аспекты // Архивъ внутренней медицины. 2020. № 2 (52). URL: https://cyberleninka.ru/article/n/novaya- koronavirusnayainfektsiya-covid-19-kliniko- epidemiologicheskieaspekty (дата обращения: 17.03.2021).Nikiforov V.V., Suranova T. G., Chernobrovkina T. Ya., Yankovskaya Ya.D., Burova S. V. New Coronavirus Infection (Covid-19): Clinical and Epidemiological Aspects. The Russian Archives of Internal Medicine. 2020;10(2):87–93. (in Russ.) Doi: 10.20514/2226–6704–2020–10–2–87–93Шамшева О. В. Новый коронавирус COVID-19 (SARS-CoV-2) // Детские инфекции. 2020. № 1. URL: https://cyberleninka.ru/article/n/novyy- koronaviruscovid-19-sars-cov-2 (дата обращения: 17.03.2021).Shamsheva O. V. New coronavirus COVID-19 (SARSCoV-2). Children’s infections. 2020. No. 1. URL: https://cyberleninka.ru/article/n/novyy- koronaviruscovid-19-sars-cov-2 (accessed 17.03.2021). (in Russ.) Шамшева О. В. 4. Gu J., Han, B., Wang J. COVID-19: gastrointestinal manifestations and potential fecal–oral transmission. Gastroenterology. 2020;158(6):1518–19. DOI: 10.1053/j.gastro. 2020.02.054.Gu J., Han, B., Wang J. COVID-19: gastrointestinal manifestations and potential fecal–oral transmission. Gastroenterology. 2020;158(6):1518–19. DOI: 10.1053/j.gastro. 2020.02.054.Xiao F., Tang M., Zheng X. et аl. Evidence for gastrointestinal infection of SARS-CoV-2. Gastroenterology. 2020; 158(6):1831–33. DOI:10.1053/j. gastro.2020.02.055Xiao F., Tang M., Zheng X. et аl. Evidence for gastrointestinal infection of SARS-CoV-2. Gastroenterology. 2020; 158(6):1831–33. DOI:10.1053/j. gastro.2020.02.055Zhang W., Du R. H., Li B., et аl. Molecular and serological investigation of 2019-nCoV infected patients: implication of multiple sheddingroutes. Emerg Microbes Infect. 2020;9(1):386–9. DOI:10.1080/22221751.2020.1729071Zhang W., Du R. H., Li B., et аl. Molecular and serological investigation of 2019-nCoV infected patients: implication of multiple sheddingroutes. Emerg Microbes Infect. 2020;9(1):386–9. DOI:10.1080/22221751.2020.1729071Tang A., Tong Z. D., Wang H. L., et al. Detection of novel coronavirus by RTPCR in stool specimen from asymptomatic child, China. Emerg Infect Dis. 2020;26(6):1337–39. DOI: 10.3201/ eid2606.200301.Tang A., Tong Z. D., Wang H. L., et al. Detection of novel coronavirus by RTPCR in stool specimen from asymptomatic child, China. Emerg Infect Dis. 2020;26(6):1337–39. DOI: 10.3201/ eid2606.200301.Young B.E., Ong S. W.X., Kalimuddin S., et al. Epidemiologic features and clinical course of patients infected with SARS-CoV-2 in Singapore. JAMA. 2020;323(15):1488–94. DOI:10.1001/ jama.2020.3204Young B.E., Ong S. W.X., Kalimuddin S., et al. Epidemiologic features and clinical course of patients infected with SARS-CoV-2 in Singapore. JAMA. 2020;323(15):1488–94. DOI:10.1001/ jama.2020.3204Chan K.H., Poon L. L., Cheng V. C., et al. Detection of SARS coronavirus in patients with suspected SARS. Emerg Infect Dis. 2004;10(2):294–9. DOI:10.3201/eid1002.030610Chan K.H., Poon L. L., Cheng V. C., et al. Detection of SARS coronavirus in patients with suspected SARS. Emerg Infect Dis. 2004;10(2):294–9. DOI:10.3201/eid1002.030610Wu Y., Guo C., Tang L., et al. Prolonged presence of SARS-CoV-2 viral RNA in faecal samples. Lancet Gastroenterol Hepatol. 2020;5(5):434–35. DOI: 10.1016/S2468–1253(20)30083–2Wu Y., Guo C., Tang L., et al. Prolonged presence of SARS-CoV-2 viral RNA in faecal samples. Lancet Gastroenterol Hepatol. 2020;5(5):434–35. DOI: 10.1016/S2468–1253(20)30083–2To K.K.W., Tsang O. T.Y., Yip C. C.Y., et al. onsistent detection of 2019 novel coronavirus in saliva. Clin Infect Dis. 2020; 12:149. DOI: 10.1093/cid/ciaa149To K.K.W., Tsang O. T.Y., Yip C. C.Y., et al. onsistent detection of 2019 novel coronavirus in saliva. Clin Infect Dis. 2020; 12:149. DOI: 10.1093/cid/ciaa149Ivashkin V. T., Sheptulin A. A., Zolnikova O. Yu., et al. New coronavirus infection (COVID-19) and the digestive system. Russian Journal of Gastroenterology, Hepatology, and Coloproctology. 2020; 30(3) p.7–14. (in Russ.)Ивашкин В. Т., Шептулин А. А., Зольникова О. Ю., и соавт. Новая коронавирусная инфекция (COVID-19) и система органов пищеварения // Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. – 2020; 30(3) С. 7–14.Lu R., Zhao X., Li J., Niu P., et al. Genomic characterization and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. Lancet. 2020; 395(10224):565–74. DOI: 1016/ S0140–6736(20)30251–8Lu R., Zhao X., Li J., Niu P., et al. Genomic characterization and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. Lancet. 2020; 395(10224):565–74. DOI: 1016/ S0140–6736(20)30251–8Zhou P., Yang X. L., Wang X. G., et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature. 2020; 579(7798):270–273. DOI: 10.1038/s41586–020–2012–7Zhou P., Yang X. L., Wang X. G., et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature. 2020; 579(7798):270–273. DOI: 10.1038/s41586–020–2012–7Liang W., Feng Z., Rao S., et al. Diarrhoea may be underestimated: a missing link in 2019 novel coronavirus. Gut. 2020;69(6):1141–43. DOI: 10.1136/gutjnl-2020–320832Liang W., Feng Z., Rao S., et al. Diarrhoea may be underestimated: a missing link in 2019 novel coronavirus. Gut. 2020;69(6):1141–43. DOI: 10.1136/gutjnl-2020–320832Xu J., Hel fand B. Genet ic risk score linked withyounger age diagnosis of prostate cancer. Oncology Times. 2020;42(6):8,36. DOI:10.1097/01.cot.0000658832.18056.12Xu J., Hel fand B. Genet ic risk score linked withyounger age diagnosis of prostate cancer. Oncology Times. 2020;42(6):8,36. DOI:10.1097/01.cot.0000658832.18056.12Chai X., Hu L., Zhang Y., et al. Specific ACE2 Expression in cholangiocytes COVID-19 may cause liver damage aft er 2019-nCoV infection. bioRxiv. 2020; DOI:10.1101/2020.02.03.931766Chai X., Hu L., Zhang Y., et al. Specific ACE2 Expression in cholangiocytes COVID-19 may cause liver damage aft er 2019-nCoV infection. bioRxiv. 2020; DOI:10.1101/2020.02.03.931766Lviv D. K., Kolobukhina L. V., Deryabin P. G. Coronavirus infection. Severe acute respiratory syndrome. Infectious diseases: News. Opinions. Training. 2015. No. 4 (13). (in Russ.) URL: https://cyberleninka.ru/article/n/koronavirusnaya- infektsiya-tyazhelyy- ostryyrespiratornyy-sindrom (accessed 17.03.2021).Львов Д. К., Колобухина Л. В., Дерябин П. Г. Коронавирусная инфекция. Тяжелый острый респираторный синдром // Инфекционные болезни: Новости. Мнения. Обучение. 2015. № 4 (13). URL: https://cyberleninka.ru/article/n/koronavirusnayainfektsiya-tyazhelyy- ostryy-respiratornyy-sindrom (дата обращения: 17.03.2021).Kapustin D. V., Khokhlova N. I., Krasnova E. I., et al. Modern aspects of acute gastroenteritis of viral etiology. Journal of Siberian Medical Science. 2019, No.2, pp.106–118. (in Russ.)Капустин Д. В., Хохлова Н. И., Краснова Е. И., и соавт. Современные аспекты острого гастроэнтерита вирусной этиологии. Journal of Siberian Medical Science. 2019. No2, pp.106–118.Pan L, Mu M, Yang P., et al. Clinical characteristics of COVID-19 patients with digestive symptoms in Hubei, China: a descriptive, cross- sectional, multicenter study. Th e American Journal of Gastroenterology. 10.14309/ajg.0000000000000620Pan L, Mu M, Yang P., et al. Clinical characteristics of COVID-19 patients with digestive symptoms in Hubei, China: a descriptive, cross- sectional, multicenter study. Th e American Journal of Gastroenterology. 10.14309/ajg.0000000000000620Pan L, Mu M, Yang P., et al. Clinical characteristics of COVID-19 patients with digestive symptoms in Hubei, China: a descriptive, cross- sectional, multicenter study. Th e American Journal of Gastroenterology. 10.14309/ajg.0000000000000620

The authors declare that there are no conflicts of interest present.