nogrЭкспериментальная и клиническая гастроэнтерологияExperimental and Clinical Gastroenterology1682-8658«Global Media Technologies»10.31146/1682-8658-ecg-182-10-11-17nogr-1444Research ArticleКЛИНИЧЕСКАЯ ГАСТРОЭНТЕРОЛОГИЯCLINICAL GASTROENTEROLOGYКлинико-эпидемиологическая и молекулярно-генетическая характеристика острых кишечных вирусных инфекций в НовосибирскеClinico-epidemiological features and molecular-genetic characteristics of acute intestinal infections of viral etiology in NovosibirskКапустинД. В.KapustinD. V.

ассистент кафедры инфекционных болезней

Российская Федерация, 630091, г. Новосибирск, Красный проспект, 52

г. Новосибирск, ул. Семьи-Шамшиных, 40, Россия

630091, Novosibirsk, Krasnyj prospect, 52

Novosibirsk, Sem'i-SHamshinyh, 40, Russia

dmitrij_kapustin_1991@inbox.ruКрасноваЕ. И.KrasnovaE. I.

заведующий кафедрой инфекционных болезней, д. м. н., профессор

Российская Федерация, 630091, г. Новосибирск, Красный проспект, 52

г. Новосибирск, ул. Семьи-Шамшиных, 40, Россия

630091, Novosibirsk, Krasnyj prospect, 52

Novosibirsk, Sem'i-SHamshinyh, 40, Russia

ЖираковскаяЕ. В.ZhirakovskaiaE. V.

научный сотрудник лаборатории Молекулярной микробиологии, к. б. н.

г. Новосибирск, пр. Ак. Лаврентьева, 8, Россия

Laboratory of Molecular Microbiology, research fellow, Ph.D. 

Novosibirsk, pr. Ak. Lavrent'eva, 8, Russia

ХохловаН. И.KhokhlovaN. I.

доцент кафедры инфекционных болезней, к. м. н., доцент

Российская Федерация, 630091, г. Новосибирск, Красный проспект, 52

г. Новосибирск, ул. Семьи-Шамшиных, 40, Россия

 

630091, Novosibirsk, Krasnyj prospect, 52

Novosibirsk, Sem'i-SHamshinyh, 40, Russia

СоколовС. Н.SokolovS. N.

отдел «Коллекция микроорганизмов», научный сотрудник

г. Новосибирск, пр. Ак. Лаврентьева, 8, Россия

г. Новосибирск, р. п. Кольцово, Россия

research fellow

Novosibirsk, pr. Ak. Lavrent'eva, 8, Russia

Koltsovo, Novosibirsk, Russia

ТикуноваН. В.TikunovaN. V.

заведующий лабораторией Молекулярной микробиологии, д. б. н.

г. Новосибирск, пр. Ак. Лаврентьева, 8, Россия

Head of the Laboratory of Molecular Microbiology, Doctor of Biological Sciences

Novosibirsk, pr. Ak. Lavrent'eva, 8, Russia

КуимоваИ. В.KuimovaI. V.

профессор кафедры инфекционных болезней, д. м. н., доцент

Российская Федерация, 630091, г. Новосибирск, Красный проспект, 52

630091, Novosibirsk, Krasnyj prospect, 52Novosibirsk, Sem'i-SHamshinyh, 40, Russia

ЕвстроповА. Н.EvstropovA. N.

заведующий кафедрой микробиологии, профессор, д. м. н

Российская Федерация, 630091, г. Новосибирск, Красный проспект, 52

Head of the department of Microbiology, Doctor of Medicine, professor 630091, Novosibirsk, Krasnyj prospect, 52

КузнецоваВ. Г.KuznetsovaV. G.

профессор кафедры инфекционных болезней, д. м. н., доцент

Российская Федерация, 630091, г. Новосибирск, Красный проспект, 52

assistant professor of the department of Infectious Diseases, Doctor of Medicine 630091, Novosibirsk, Krasnyj prospect, 52

ПанасенкоЛ. М.PanasenkoL. M.

профессор кафедры пропедевтики детских болезней, д. м. н., доцент

Российская Федерация, 630091, г. Новосибирск, Красный проспект, 52

assistant professor of the department of Propaedeutics Childhood Diseases, Doctor of Medicine 630091, Novosibirsk, Krasnyj prospect, 52

ИзвековаИ. Я.IzvekovaI. Ya.

профессор кафедры инфекционных болезней, д. м. н

Российская Федерация, 630091, г. Новосибирск, Красный проспект, 52

assistant professor of the department of Infectious Diseases, Doctor of Medicine

630091, Novosibirsk, Krasnyj prospect, 52

ЛукашоваЛ. В.LukashovaL. V.

заведующий кафедрой инфекционных болезней и эпидемиологии, д. м. н., доцент

г. Томск, Московский тракт, 2, Россия

Head of the Department of Infectious Diseases and Epidemiology, Doctor of Medicine, Associate Professor

Tomsk, Moskovskij trakt, 2, Russia

ФГБОУ ВО Новосибирский государственный медицинский университет Минздрава России; ГБУЗ НСО «Городская инфекционная клиническая больница № 1»РоссияFederal State Budget Educational Institution of Higher Education “Novosibirsk State Medical University” Ministry of Health of the Russian Federation; “City Infectious Clinical Hospital No.1”Russian FederationФГБУН Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАНРоссияInstitute of Chemical Biology and Fundamental Medicine of the SB RASRussian FederationФГБУН Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН; ФБУН Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» РоспотребнадзораРоссияInstitute of Chemical Biology and Fundamental Medicine of the SB RAS; State Research Center of Virology and Biotechnology VectorRussian FederationФГБОУ ВО Новосибирский государственный медицинский университет Минздрава РоссииРоссияFederal State Budget Educational Institution of Higher Education “Novosibirsk State Medical University” Ministry of Health of the Russian Federation; “City Infectious Clinical Hospital No.1”Russian FederationФГБОУ ВО Новосибирский государственный медицинский университет Минздрава РоссииРоссияFederal State Budget Educational Institution of Higher Education “Novosibirsk State Medical University” Ministry of Health of the Russian FederationRussian FederationФГБОУ ВО Сибирский государственный медицинский университет Минздрава России, кафедра инфекционных болезней и эпидемиологииРоссияSiberian State Medical University of the Ministry of Health of RussiaRussian Federation2020261020200101117Copyright © Капустин Д.В., Краснова Е.И., Жираковская Е.В., Хохлова Н.И., Соколов С.Н., Тикунова Н.В., Куимова И.В., Евстропов А.Н., Кузнецова В.Г., Панасенко Л.М., Извекова И.Я., Лукашова Л.В., 20202020Капустин Д.В., Краснова Е.И., Жираковская Е.В., Хохлова Н.И., Соколов С.Н., Тикунова Н.В., Куимова И.В., Евстропов А.Н., Кузнецова В.Г., Панасенко Л.М., Извекова И.Я., Лукашова Л.В.Kapustin D.V., Krasnova E.I., Zhirakovskaia E.V., Khokhlova N.I., Sokolov S.N., Tikunova N.V., Kuimova I.V., Evstropov A.N., Kuznetsova V.G., Panasenko L.M., Izvekova I.Y., Lukashova L.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.nogr.org/jour/article/view/1444Цель исследования

Цель исследования: установить частоту острых кишечных инфекций вирусной этиологии в Новосибирской области, их клинико-эпидемиологическое особенности и молекулярно-генетическое разнообразие для обоснования рациональных подходов к  диагностике и лечению. 

Материалы и методы

Материалы и методы: Обследованы 1500 больных в возрасте от 18 лет до 91 лет, госпитализированных с диагнозом острая кишечная инфекция (ОКИ) с января 2016 г. по февраль 2018 г. Наряду с общепринятыми методами диагностики, исследованы фекалии  методом ПЦР на присутствие астровирусов, а также ротавирусов и норовирусов второй геногруппы.

Результаты

Результаты: Вирусная этиология ОКИ установлена у 332 (22,1%) пациентов.  Астровирусная инфекция (АВИ) диагностирована у 27 больных (1,7%), уступая по  частоте норовирусам (НВИ) (13.3%) и ротавирусам (РВИ) (7%). Вирусные диареи регистрировались чаще у женщин 56,9%. Возраст больных варьировал от 18 до 91 года и в среднем составил (30,2 ± 1,9) лет. В половине случаев АВИ (48.1%) установлено употребление накануне заболевания морепродуктов. Среднетяжелая форма зарегистрирована у 90,1% больных вирусными ОКИ, у 9,9% — тяжелая. Тяжелые формы при НВИ встречались в 13,6%, чаще, чем при РВИ — 5 больных (4,7%); и АВИ (3,7%). Установлено, что у большинства больных (96,3%) с тяжелой степенью дегидратации выявлены ранее не встречаемые на территории Новосибирской области рекомбинантные  штаммы норовирусов (GII.P17/GII.17, GII.Pe/GII.4 Sydney). У 93,1% больных вирусными ОКИ заболевание начиналось с лихорадки. У подавляющего большинства  пациентов с вирусной этиологией ОКИ наблюдалась многократная водянистая диарея (91,6%). В гемограмме у большинства больных вирусными ОКИ при поступлении число лейкоцитов было в норме. Средние показатели лейкоцитов у больных ОКИ различной  этиологии не отличались.

Заключение

Заключение: Отсутствие специфических проявлений вирусных ОКИ различной  этиологии определяет необходимость внедрения в клиническую практику тест-систем для  верификации вирусных возбудителей. Целесообразно определение генотипов норовирусов как с эпидемиологической точки зрения, так и для прогнозирования риска развития тяжелых форм в случаях выявления новых, ранее не встречавшихся, рекомбинантных штаммов.

The objective of the study: to establish the frequency of acute intestinal infections of viral etiology in the Novosibirsk region, their clinical and epidemiological features and molecular and genetic diversity to justify rational approaches to diagnosis and treatment.

Materials and methods

Materials and methods: 1500 patients aged 18 to 91 years were hospitalized with a diagnosis of acute intestinal infection (AII) from January 2016 to February 2018. Along with conventional diagnostic methods, faeces were examined by PCR for the presence of astroviruses, as well as rotaviruses and noroviruses of the second genogroup.

Results

Results: the Viral etiology of AII was established in 332 (22.1%) patients. Astrovirus infection (AII) was diagnosed in 27 patients (1.7%), second in frequency to noroviruses (NVI) (13.3%) and rotaviruses (RVI) (7%). Viral diarrhea were detected more often in women 56.9 per cent. The age of patients varied from 18 to 91 years and averaged (30.2 ± 1.9) years. In half of the cases of AVI (48.1%), the use of seafood on the eve of the disease was established. The moderate form was registered in 90.1% of patients with viral OCI, and in  9.9% — severe. Severe forms of NVI occurred in 13.6%, more often than in rvi-5 patients (4.7%); and AVI (3.7%). It was found that in the majority of patients (96.3%) with severe dehydration, recombinant strains of noroviruses (GII.P17/GII. 17, GII.Pe/GII.4 Sydney). In 93.1% of patients with viral OCI, the disease started with fever. The vast majority of patients with the viral etiology of OKI had multiple watery diarrhea (91.6%). In the hemogram of the majority of patients with viral OCI, the number of white blood cells was normal at admission. The average values of white blood cells in patients with AII of diff erent etiology did not differ.

Conclusion

Conclusion: The absence of specifi c manifestations of viral AII of various etiologies determines the need to introduce test systems for verifi cation of viral pathogens into clinical practice. It is advisable to determine the genotypes of noroviruses both from an epidemiological point of view and to predict the risk of severe forms in cases of detection of new, previously unknown, recombinant strains.

острая кишечная инфекцияастровирусыноровирусыротавирусыполимеразная цепная реакциягенотипированиеacute intestinal infectionastrovirusesnorovirusesrotavirusespolymerase chain reactiongenotypingИсследование проводилось по базовому проекту ПФНИ ГАН (№ 55.1.1, 0309–2016–0002) «Биология бактериально-вирусных сообществ».ReferencesГорелов, А. В. Острые кишечные инфекции у детей: отдаленные исходы, факторы их определяющие. Оптимизация путей реабилитации / А. В. Горелов, М. А. Григорович, Москва; Киров: Веси, 2012, 206 с, ISBN: 978–5–4338–0091–5.Gorelov A. V., Grigorovich M. A. Acute intestinal infections in children: long-term outcomes, their determining factors. Optimization of rehabilitation paths. Moscow; Kirov: Vesi. 2012, 206 p.Gorelov A. V., Grigorovich M. A. Acute intestinal infections in children: long-term outcomes, their determining factors. Optimization of rehabilitation paths. Moscow; Kirov: Vesi. 2012, 206 p.Desselberger, U. Global issues related to enteric viral infections / U. Desselberger. Virus Dis, 2014, Vol. 25, no. 2, pp. 147–149, DOI: 10.1007/s13337–014–0223-y.Desselberger, U. Global issues related to enteric viral infections / U. Desselberger. Virus Dis, 2014, Vol. 25, no. 2, pp. 147–149, DOI: 10.1007/s13337–014–0223-y.Ahmed S. M., Hall A. J., Robinson A. E., et al. Global prevalence of norovirus in cases of gastroenteritis: a systematic review and meta-analysis. Lancet Infect. Dis, 2014, Vol. 14, no. 8, pp. 725–730, DOI: 1016/S1473–3099(14)70767–4.Ahmed S. M., Hall A. J., Robinson A. E., et al. Global prevalence of norovirus in cases of gastroenteritis: a systematic review and meta-analysis. Lancet Infect. Dis, 2014, Vol. 14, no. 8, pp. 725–730, DOI: 1016/S1473–3099(14)70767–4.Blanco A., Guix S., Fuster N. et al. Norovirus in Bottled Water Associated with Gastroenteritis Outbreak, Spain, 2016ю Emerg. Infect. Dis, 2017, Vol. 23, no. 9, pp.1531–1534, DOI: 10.3201/eid2309.161489.Blanco A., Guix S., Fuster N. et al. Norovirus in Bottled Water Associated with Gastroenteritis Outbreak, Spain, 2016ю Emerg. Infect. Dis, 2017, Vol. 23, no. 9, pp.1531–1534, DOI: 10.3201/eid2309.161489.Maleev V. V., Gorelov A. V., Usenko D. V., Kuleshov K. I. Actual problems, results and prospects of studying acute intestinal infections. Epidemiology and infectious diseases. 2014, No. 1, pp. 4–10.Актуальные проблемы, итоги и перспективы изучения острых кишечных инфекций / В. В. Малеев, А. В. Горелов, Д. В. Усенко, К. И. Кулешов. Эпидемиология и инфекционные болезни, 2014, no. 1, С. 4. Maleev V. V., Gorelov A. V., Usenko D. V., Kuleshov K. I. Actual problems, results and prospects of studying acute intestinal infections. Epidemiology and infectious diseases. 2014, No. 1, pp. 4–10.Oude Munnink, B. B. Viruses Causing Gastroenteritis: The Known, The New and Those Beyond. Viruses, 2016, Vol. 8, no. 2, pp. pii E42, DOI: 10.3390/v8020042.Oude Munnink, B. B. Viruses Causing Gastroenteritis: The Known, The New and Those Beyond. Viruses, 2016, Vol. 8, no. 2, pp. pii E42, DOI: 10.3390/v8020042.On the state of sanitary and epidemiological well-being of the population in the Russian Federation in 2016: State report. – Moscow: Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Welfare, 2017, 220 p. URL: https://addictology.ru/wp-сontent/uploads/2017/06/doklad_alko2016.pdf2017 (date accessed: 12.10.2019).О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2016 году: Государственный доклад, Москва: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2017, 220 с, URL: https://addictology.ru/wp-content/uploads/2017/06/doklad_alko2016.pdf2017 (дата обращения: 12.10.2019), Текст: электронный. On the state of sanitary and epidemiological well-being of the population in the Russian Federation in 2016: State report. – Moscow: Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Welfare, 2017, 220 p. URL: https://addictology.ru/wp-content/uploads/2017/06/doklad_alko2016.pdf2017 (date accessed: 12.10.2019).О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2016 году: Государственный доклад, Москва: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2017, 220 с, URL: https://addictology.ru/wp-content/uploads/2017/06/doklad_alko2016.pdf2017 (дата обращения: 12.10.2019), Текст: электронный. On the state of sanitary and epidemiological well-being of the population in the Russian Federation in 2016: State report. – Moscow: Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Welfare, 2017, 220 p. URL: https://addictology.ru/wp-content/uploads/2017/06/doklad_alko2016.pdf2017 (date accessed: 12.10.2019).

The authors declare that there are no conflicts of interest present.