nogrЭкспериментальная и клиническая гастроэнтерологияExperimental and Clinical Gastroenterology1682-8658«Global Media Technologies»10.31146/1682-8658-ecg-179-7-78-85nogr-1399Research ArticleКЛИНИЧЕСКАЯ ГАСТРОЭНТЕРОЛОГИЯCLINICAL GASTROENTEROLOGYОсобенности микробиоты кишечника при язвенном колитеFeatures of intestinal microbiota in ulcerative colitisКупаеваВ. А.KupaevaV. A.

Купаева Виктория Александровна - ассистент кафедры гастроэнтерологии, врач-гастроэнтеролог консультативной поликлиники.Москва.

Victoria A. Kupaeva - Assistant of the Department of Gastroenterology, Gastroenterologist of the clinic.Moscow.

victoriakupaeva@gmail.comЛоранскаяИ. Д.LoranskayaI. D.

Лоранская Ирина Дмитриевна - доктор медицинских наук, профессор, заведующая кафедрой гастроэнтерологии.Москва.

Irina D. Loranskaya - Doctor of Medical Science, Professor, Head of the Department of Gastroenterology.Moscow.

БолдыреваМ. Н.BoldyrevaM. N.

Болдырева Маргарита Николаевна - доктор медицинских наук, ведущий научный сотрудник.Москва.

Margarita N. Boldyreva - Doctor of Medical Science, Senior research associate.Moscow.

НанаеваБ. A.NanaevaB. A.

Нанаева Бэлла Александровна - кандидат медицинских наук, заведующая гастроэнтерологическим отделением.Москва.

Bella A. Nanaeva - PhD, Head of gastroenterological department.Moscow.

ШапинаМ. В.ShapinaM. V.

Шапина Марина Владимировна - кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник, руководитель отдела по изучению воспалительных и функциональных заболеваний кишечника, доцент кафедры колопроктологии.Москва.

Marina V. Shapina - PhD, Chief of the inflammatory and functional bowel diseases unit, Associate Professor of the Department of Coloproctology.Moscow.

Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования Минздрава России; НМИЦ колопроктологии им. А.Н. Рыжих Минздрава РоссииРоссияRussian Medical Academy of Continuous Professional Education; State Scientific Centre of ColoproctologyRussian FederationРоссийская медицинская академия непрерывного профессионального образования Минздрава РоссииРоссияRussian Medical Academy of Continuous Professional EducationRussian FederationГНЦ Институт иммунологии ФМБА РоссииРоссияNRC Institute of Immunology FMBA of RussiaRussian FederationНМИЦ колопроктологии им. А.Н. Рыжих Минздрава РоссииРоссияState Scientific Centre of ColoproctologyRussian Federation202027092020077885Copyright © Купаева В.А., Лоранская И.Д., Болдырева М.Н., Нанаева Б.A., Шапина М.В., 20202020Купаева В.А., Лоранская И.Д., Болдырева М.Н., Нанаева Б.A., Шапина М.В.Kupaeva V.A., Loranskaya I.D., Boldyreva M.N., Nanaeva B.A., Shapina M.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.nogr.org/jour/article/view/1399

Исследование посвящено одной из самых обсуждаемых проблем последнего десятилетия не только в гастроэнтерологии, но и научном мире в целом. Чем больше у нас появляется знаний и представлений о составе и функции микробиоты организма человека, в частности микрофлоры желудочно-кишечного тракта, как одного из самых заселенных микроорганизмами отделов человеческого тела, тем лучше мы осознаем, что находимся лишь в начале сложного пути. Эволюция методов диагностики микробного состава от посева кала на обогащенные питательные среды до современных молекулярно-генетических методик, позволяющих выделить генетический материал бактерий, безусловно, играет ключевую роль в нашем понимании данного вопроса и попытках установить роль микроорганизмов в развитии заболеваний различных органов и систем человека. Воспалительные заболевания кишечника (ВЗК), в частности язвенный колит, относятся к патологическим состояниям с неясной этиологией, характеризующимся хроническим тяжелым течением, разнообразной клинической картиной, трудностью постановки диагноза и постоянным поддерживающим лечением. В данной работе с помощью современных методов диагностики предпринята попытка приблизиться к пониманию изменений, происходящих в микробиоте кишечника при язвенном колите, определению вероятных этиологических и патогенетических агентов и выделению возможных мишеней воздействия в качестве дополнительных методов лечения заболевания.

The study is dedicated to one of the most discussed problems of the last decade, not only in gastroenterology, but also in the scientific world. The more knowledge and ideas we have about the composition and function of the microbiota of the human body, in particular the microflora of the gastrointestinal tract, as one of the most populated department by microorganisms of the human body, the better we realize that we are only at the beginning of the this way. The evolution of methods for diagnosing of microbiota from microbiological method to modern molecular genetic techniques to isolate the genetic material of bacteria, of course, plays a key role in our understanding of this issue, attempts to establish the role of microorganisms in the development of diseases of various human systems. Inflammatory bowel diseases, including ulcerative colitis, belong to pathological conditions with an unclear etiology characterized by a chronic severe course, a diverse clinical picture, difficulty in establishing a diagnosis, long-term treatment. In this research with the modern diagnostic methods an attempt is made to come closer to understanding the changes that occur in the intestinal microbiota with ulcerative colitis, identifying probable etiological and pathogenetic agents, and identifying possible targets for exposure as additional methods of treating the disease.

язвенный колитмикробиотамикробиомПЦР (полимеразная цепная реакция) в режиме реального времениulcerative colitismicrobiotamicrobiomereal-time PCR (polymerase chain reaction)ReferencesАдлер Г. Болезнь Крона и язвенный колит / Г. Адлер; пер. с нем. А. А. Шептулина, М.: ГОЭТАР-МЕД, 2001, 500 с.Adler G. Bolezn' Krona i yazvennyj kolit. M.: GOETAR-MED, 2001. 500 P.Клинические рекомендации российской гастроэнтерологической ассоциации и ассоциации колопроктологов России по диагностике и лечению язвенного колита//Колопроктология, 2017, № 1(59), С. 6-30.Klinicheskie rekomendacii rossijskoj gastroentero-logicheskoj associacii i associacii koloproktologov Rossii po diagnostike i lecheniyu yazvennogo kolita. Koloproktologiya. 2017. no. 1(59), pp.6-30.Лоранская И.Д., Халиф И. Л., Болдырева М. Н., Купаева В. А. Характеристика микробиома при воспалительных заболеваниях кишечника. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология,2018, № 153(5), С. 104-111.Loranskaya I. D., Khalif I. L., Boldyreva M. N., Kupaeva V. A. Characteristic of microbiome in inflammatory bowel disease (Review) . Experimental and Clinical Gastroenterology. 2018;(5):104-111. (In Russ.)Пристеночная микрофлора кишечника. И. Д. Лоран-ская и др, M.: Прима Принт, 2015, 100 С.Loranskaya I. D. et al. Pristenochnaya mikroflora kishechnika. M.: Prima Print, 2015. 100 P.ПЦР в реальном времени / Д. В. Ребриков [и др.]; под ред.д.б.н. Д. В. Ребрикова, 7-е изд, М.: Лаборатория знаний, 2019, 223 с.Rebrikov D. V. et al. PCR v real'nom vremeni. 7-e izd. M.: Laboratoriya znanij, 2019. 223 P.Чаплин А.В., Ребриков Д. В., Болдырева М. Н. Микробиом человека. Вестник РГМУ, 2017, no. 2, С. 5-13.Chaplin A. V., Rebrikov D. V., Boldyreva M. N. Mikrobiom cheloveka. Vestnik RGMU. 2017, no. 2, pp. 5-13.Andrews C.N., Griffi ths T. A., Kaufman J. et al. Mesalazine (5-aminosalicylic acid) alters fecal bacterial profiles, but not mucosal proteolytic activity in diarrhea-predominant irritable bowel syndrome. Aliment Pharmacol Ther. 2011. no. 34(3), pp. 374-83.Andrews C.N., Griffi ths T. A., Kaufman J. et al. Mesalazine (5-aminosalicylic acid) alters fecal bacterial profiles, but not mucosal proteolytic activity in diarrhea-predominant irritable bowel syndrome. Aliment Pharmacol Ther. 2011. no. 34(3), pp. 374-83.Bharadwaj R. S. Role of bacteria in Inflammatory bowel disease (IBD). International Journal of Infectious Diseases. 2016, Vol.45, Suppl. 1, pp. 134.Bharadwaj R. S. Role of bacteria in Inflammatory bowel disease (IBD). International Journal of Infectious Diseases. 2016, Vol.45, Suppl. 1, pp. 134.Biasco G., Zannoni U., Paganelli G. M.et al. Folic acid supplementation and cell kinetics of rectal mucosa in patients with ulcerative colitis. Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev, 1997, no. 6, pp.469-471.Biasco G., Zannoni U., Paganelli G. M.et al. Folic acid supplementation and cell kinetics of rectal mucosa in patients with ulcerative colitis. Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev, 1997, no. 6, pp.469-471.Frank D.N., Amand A. L. St, Feldman R. A. et al. Molecular-phylogenetic characterization of microbial community imbalances in human inflammatory bowel diseases. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A, 2007, no. 104, pp.13780-13785.Frank D.N., Amand A. L. St, Feldman R. A. et al. Molecular-phylogenetic characterization of microbial community imbalances in human inflammatory bowel diseases. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A, 2007, no. 104, pp.13780-13785.Frick J.S., Autenrieth I. B. The gut microflora and its variety of roles in health and disease. Curr Top Microbiol Immunol, 2013, no. 358, pp.273-89.Frick J.S., Autenrieth I. B. The gut microflora and its variety of roles in health and disease. Curr Top Microbiol Immunol, 2013, no. 358, pp.273-89.Huang E.Y., Inoue T., Leone V. A. et al. Using corticosteroids to reshape the gut microbiome: implications for inflammatory bowel diseases. Inflamm Bowel Dis, 2015, no. 21(5), pp. 963-72.Huang E.Y., Inoue T., Leone V. A. et al. Using corticosteroids to reshape the gut microbiome: implications for inflammatory bowel diseases. Inflamm Bowel Dis, 2015, no. 21(5), pp. 963-72.Kabeerdoss J., Sankaran V., Pugazhendhi S. et al. Clostridium leptum group bacteria abundance and diversity in the fecal microbiota of patients with inflammatory bowel disease: a case-control study in India. BMC Gastroenterol, 2013, 13:20.Kabeerdoss J., Sankaran V., Pugazhendhi S. et al. Clostridium leptum group bacteria abundance and diversity in the fecal microbiota of patients with inflammatory bowel disease: a case-control study in India. BMC Gastroenterol, 2013, 13:20.Man S.M., Kaakoush N. O., Leach S. T. et al. Host attachment, invasion, and stimulation of proinflammatory cytokines by Campylobacter concisus and other non-Cam-pylobacter jejuni Campylobacter species. J. Infect. Dis, 2010, no. 202, pp.1855-65.Man S.M., Kaakoush N. O., Leach S. T. et al. Host attachment, invasion, and stimulation of proinflammatory cytokines by Campylobacter concisus and other non-Cam-pylobacter jejuni Campylobacter species. J. Infect. Dis, 2010, no. 202, pp.1855-65.Nagao-Kitamoto H., Kamada N. Host-microbial Crosstalk in Inflammatory Bowel Disease. Immune Netw, 2017, № .17(1), pp.1-12.Nagao-Kitamoto H., Kamada N. Host-microbial Crosstalk in Inflammatory Bowel Disease. Immune Netw, 2017, № .17(1), pp.1-12.Shin S.J., Collins M. T. Thiopurine drugs azathioprine and 6-mercaptopurine inhibit Mycobacterium paratuberculosis growth in vitro. Antimicrob Agents Chemother, 2008, no. 52(2), 418-26.Shin S.J., Collins M. T. Thiopurine drugs azathioprine and 6-mercaptopurine inhibit Mycobacterium paratuberculosis growth in vitro. Antimicrob Agents Chemother, 2008, no. 52(2), 418-26.Sokol H., Seksik P., Rigottier-Gois L. et al. Specificities of the fecal microbiota in inflammatory bowel disease. Inflamm. Bowel Dis, 2006, no. 12, pp.106-111.Sokol H., Seksik P., Rigottier-Gois L. et al. Specificities of the fecal microbiota in inflammatory bowel disease. Inflamm. Bowel Dis, 2006, no. 12, pp.106-111.Swidsinski A., Loening-Baucke V., Bengmark S. et al. Azathioprine and mesalazine-induced effects on the mucosal flora in patients with IBD colitis. Inflamm Bowel Dis, 2007, no. 13(1), pp.51-6.Swidsinski A., Loening-Baucke V., Bengmark S. et al. Azathioprine and mesalazine-induced effects on the mucosal flora in patients with IBD colitis. Inflamm Bowel Dis, 2007, no. 13(1), pp.51-6.Third European Evidence-based Consensus on Diagnosis and Management of Ulcerative Colitis. Journal of Crohn's and Colitis, 2017, Vol. 11, Issue 6, pp. 649-670.Third European Evidence-based Consensus on Diagnosis and Management of Ulcerative Colitis. Journal of Crohn's and Colitis, 2017, Vol. 11, Issue 6, pp. 649-670.Vermeiren J., Van den Abbeele P., Laukens D. et al. Decreased colonization of fecal Clostridium coccoides/ Eubacterium rectale species from ulcerative colitis patients in an in vitro dynamic gut model with mucin environment. FEMS Microbiol Ecol, 2012, no. 79, pp. 685-96.Vermeiren J., Van den Abbeele P., Laukens D. et al. Decreased colonization of fecal Clostridium coccoides/ Eubacterium rectale species from ulcerative colitis patients in an in vitro dynamic gut model with mucin environment. FEMS Microbiol Ecol, 2012, no. 79, pp. 685-96.Wills E.S., Jonkers D. M., Savelkoul P. H. et al. Fecal microbial composition of ulcerative colitis and Crohn's disease patients in remission and subsequent exacerbation. PLoS One, 2014;9(3): e90981.Wills E.S., Jonkers D. M., Savelkoul P. H. et al. Fecal microbial composition of ulcerative colitis and Crohn's disease patients in remission and subsequent exacerbation. PLoS One, 2014;9(3): e90981.Wilson J.C., Furlano R. I., Jick S. S. et al. Inflammatory bowel disease and the risk of autoimmune diseases. J Crohns Colitis, 2016, no. 10, pp.186-93.Wilson J.C., Furlano R. I., Jick S. S. et al. Inflammatory bowel disease and the risk of autoimmune diseases. J Crohns Colitis, 2016, no. 10, pp.186-93.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.